Homonim je mogoče obravnavati kot podmnožico homografov. Homonim lahko štejemo tudi za podmnožico homofonov. Medtem ko homograf pomeni besede, ki se pišejo enako, homofon pa besede, ki zvenijo enako, homonim pomeni besede, ki imajo enak zvok in črkovanje, vendar so različne besede. Uporabimo nekaj primerov, da pojasnimo razlike med homonimom in tema dvema podobnima pojmoma.
Homonimi, ki niso homonimi, vključujejo besede, kot sta read, ki pomenijo sedanjik glagola »brati«, in read, ki predstavlja pretekli čas istega glagola. Ker se ti dve besedi, čeprav se pišeta enako, izgovarjata različno, sta homografi, ne pa homonima.
Homofoni, ki niso homonimi, vključujejo besede, kot sta peer, kar pomeni »enako«, in pomol, ki pomeni kraj za pristajanje čolna. Ker se ti dve besedi izgovarjata enako, vendar nimata enakega črkovanja, sta homofoni, ne pa homonima.
In tretji primer besed, ki se morda zdijo homonimi, vendar niso, so večpomenske besede: besede z istim korenom, vendar z različnimi inkarnacijami, kot sta morda samostalnik in glagol. Ker gre pravzaprav za iste besede, ki se uporabljajo na različne načine, ne izpolnjujejo meril za homonime. Če pa vzamemo besedi peer, ki pomenita »oseba enakega položaja« in peer, ki pomeni »pozorno poglej«, potem imamo dve različni besedi, ki imata isto črkovanje in enak zvok, in to je primer homonima.
Homografi zmedejo ljudi, ker ima včasih isto črkovanje več izgovorov in morate določiti, na kateri pomen se sklicujete, preden veste, kako ga izgovoriti. Homofoni zmedejo ljudi, ker jim enak zvok v naših mislih daje natančno identifikacijo, in če črkovanje ne ujemamo s pomenom, imamo na koncu tipkarske napake. Homonimi nimajo nobene od teh težav: ker imajo enak črkovanje in enake zvoke, razen če so vključeni drugi homofoni z drugačnimi zvoki ali homografi z različnim črkovanjem, je z njimi res težko narediti napako.