Pri ljudeh je tanko črevo običajno sestavljeno iz treh delov; prvi, ko hrana prehaja iz želodca, je dvanajstnik. Jejunum in ileum sta druga dela, ki se običajno razlikujeta po vrstah celic, ki obdajajo notranjost trakta. Ta prvi del je struktura, podobna cevi, ki je na splošno dolga od 9.8 do 11.8 palcev (25 do 30 centimetrov). Običajno je sestavljen iz več plasti. Za histologijo dvanajstnika so značilne tudi mikroskopske strukture, imenovane Brunnerjeve žleze, ki lahko izločajo sluz, ki nevtralizira želodčne kisline.
Hrana pogosto pride v organ po štirih urah po zaužitju. Majhni kanali lahko omogočijo pretok encimov trebušne slinavke in žolča, ki prav tako nevtralizirajo kisline in pomagajo pri prebavi. Histologija dvanajstnika običajno predstavlja nagubano strukturo, zlasti v plasti sluznice, ki je tipično sestavljena iz krožnih ali prečnih gub. Obstajajo tudi izbokline, imenovane resice, ki so dolge do 0.04 palca (1 milimeter). V njihovem jedru so limfne in krvne žile ter živci.
Običajno je znotraj resic mikroskopska plast, imenovana meja čopiča, ki je sestavljena iz lasu podobnih delov celic, imenovanih mikroresice. Obstajajo tudi čašaste celice, ki izločajo sluz, ki pomaga hrani prehajati skozi cev. Mikrogubne celice sestavljajo tudi histologijo dvanajstnika; običajno delujejo tako, da predstavljajo antigene in obložijo vrsto limfnih vozličev. Celice, imenovane limfociti, se pogosto nahajajo v globlji plasti, imenovani lamina propria, ki je prav tako sestavljena iz vezivnega tkiva. Limfne strukture so lahko koncentrirane na določenih območjih, v tej plasti pa se nahajajo tudi žleze, značilne za črevesje.
Črevesne žleze, imenovane Liberkuhnove kripte, so na splošno v obliki cevi in odprte na notranji površini dvanajstnika. Običajno so tudi sluzne in druge endokrino izločajoče celice. Submukozna plast je običajno lokacija Brunnerjevih žlez, ki jih najdemo le v histologiji dvanajstnika. Na splošno jih prepoznamo po zviti, razvejani cevasti obliki, te so obložene s celicami, ki izločajo sluznico, in se običajno povezujejo s kanali, ki vodijo do črevesnih žlez.
Krožna plast in vzdolžna plast mišic običajno predstavljata pomemben del histologije dvanajstnika, ki se imenuje mišična mišica. Zunanja plast je značilna za tisto, ki jo najdemo v celotnem tankem črevesu, medtem ko seroza na splošno tvori zunanji del dvanajstnika. Ta plast je tudi sestavni del peritoneja ali tkiva, ki obdaja trebušne organe.