Fc receptorje najdemo na celicah imunskega sistema, znanih kot fagociti, ki lahko zaužijejo škodljive snovi ali antigene. Vsak Fc receptor se lahko veže na tako imenovano Fc regijo na protitelesu. Protitelesa so posebne beljakovine, ki jih proizvajajo imunske celice in se vežejo na antigene, kot so mikroorganizmi, toksini ali alergične snovi. Sposobni so jih nevtralizirati ali označiti za uničenje s strani imunskega sistema. Ko se Fc receptor na imunski celici veže na protitelo in nanj pritrjen antigen, lahko to sproži fagocitozo, kjer se antigen, obložen s protitelesi, porabi.
Obstajajo različne vrste protiteles, od katerih je vsaka specifična za drugačen antigen. To pomeni, da obstajajo tudi različni receptorji Fc, od katerih se vsak lahko veže na protitelo na svojem območju Fc. Protitelesa so znana tudi kot imunoglobulini, na kratko Ig, vrsta, znana kot IgG, pa se najpogosteje nahaja v krvi.
Protitelesa IgG so beljakovinske strukture v obliki črke Y, sestavljene iz različnih regij. Dve kraki Y sta znani kot regije Fab, kjer Fab pomeni fragment, vezavo antigena. Fc je repno območje, pri čemer Fc pomeni frakcijo, ki se lahko kristalizira. Fab regije se vežejo na antigene, medtem ko se regija Fc veže na Fc receptorje na površini celice. Fc receptorju podobna molekula je bila odkrita tudi na imunskih celicah, znanih kot limfociti B, vendar njena funkcija ni popolnoma razumljena in zdi se, da se ne veže na Fc regije na protitelesih.
Fagociti, ki učinkovito jedo škodljive delce, kot so mikrobi, so skupina, sestavljena iz različnih vrst celic s Fc receptorji, ki vežejo IgG na njihovih površinah. Vključujejo bele krvne celice imunskega sistema, znane kot makrofagi in nevtrofilci. Celice v imunskem sistemu, znane kot naravne celice ubijalke, so pokrite tudi s Fc receptorji, ki se vežejo na IgG. Naravne celice ubijalke proizvajajo dejavnike, ki povzročajo smrt škodljivih celic, kot so bakterije, in pritegnejo druge imunske celice, da jih uničijo. Fc receptor, ki se veže na drugačno protitelo, IgE, najdemo na površini mastocitov, ki se na antigene, kot je cvetni prah, odzovejo s sproščanjem snovi, ki povzročajo vnetje.
Včasih se pojavi proces, znan kot izboljšanje, odvisno od protiteles, kjer prisotnost Fc receptorja pomaga virusu, da vstopi v celico. Celica nima nobenega od receptorjev, ki jih virus potrebuje za vstop, a ko je virus vezan na protitelo, se lahko veže na Fc receptor preko Fc regije na protitelesu. Ta povečana sposobnost vstopa v celice vodi do povečane okužbe.