Endometrij je sluznica, ki je znotraj maternice. Preprečuje nastanek adhezij v srednji plasti maternice, imenovani miometrij, in zagotavlja prostor, kjer se posteljica med nosečnostjo pritrdi na maternico. Sestavljen je iz sloja epitelijskih celic, ki so povezane z miometrijom z vezivnim tkivom.
Debelina endometrija se spreminja skupaj z ženskim menstrualnim ciklusom. Med folikularnim ciklom se zgosti. V tem obdobju se maternica pripravi na sprejem morebitnega zarodka. Če je jajčece oplojeno in pride do spočetja, se posteljica, ki jo ustvari zarodek, pritrdi na steno endometrija. Ta povezava zagotavlja transport kisika in hranil od matere do zarodka.
Večino mesecev jajčece ne bo oplojeno. V teh mesecih se bo sluznica porušila in odpadla skozi proces menstruacije. Cikel se nato začne znova, saj se telo še enkrat pripravi na morebitno nosečnost. Ko je zarodek prisoten in se vsadi v maternico, se endometrij ne izloči, temveč postane del posteljice, ki zagotavlja podporo in hranila v času nosečnosti.
Spremembe v endometriju nastanejo zaradi različnih ravni hormonov. Zadebelitev notranje plasti maternice je posledica povečanja ravni estrogena. Potem ko jajcevod sprosti jajčece, se poveča tudi raven progesterona. To ustavi kopičenje celic na steni maternice in pripravi maternico za morebitno implantacijo zarodka. V mesecih, ko ni zarodka, se raven progesterona ponovno zniža, odvečna sluznica pa se izloči skozi menstrualni ciklus.
Včasih pride do zapletov pri razvoju endometrija. Nizke ravni hormonov včasih preprečijo zadebelitev notranje stene maternice. Fizični rezultat tega je amenoreja ali odsotnost menstrualnega ciklusa. Najpogosteje se pojavlja pri športnikih ali posameznikih z nizko ravnjo telesne maščobe. Povprečni cikel nastajanja in izpadanja endometrija je 28 dni, vendar se to lahko spremeni kot reakcija na stres, letni čas in izgubo ali pridobivanje teže.