Endofit je organizem, ki živi v rastlini; izraz dobesedno pomeni “notranja rastlina”. Nekateri so parazitske narave in izkoriščajo rastlino kot oskrbo s hranili ali energijo, medtem ko drugi tvorijo vzajemni odnos s svojimi gostitelji in opravljajo funkcijo, ki daje korist rastlini gostiteljici. Na primer, endofit lahko izloča kemične spojine, ki odvračajo druge rastline in odpravljajo konkurenco virov za gostiteljsko rastlino.
Praksa endosimbioze, kot je znano, je razmeroma pogosta v naravnem svetu in se zdi, da je tudi izjemno starodavna. Manjši organizmi živijo znotraj večjih v različnih okoljih, od globin oceanov do skal na najvišjih gorah. Zelo znan primer endosimbioze je lišaj. Lišaj je pravzaprav sestavljen iz dveh različnih organizmov: glive in endosimbiota, kot so alge ali cianobakterije.
V primeru endofitov je verjetno najbolj znan primer rastlinske trave. Nekatere rastline so kolonizirane z glivami, zaradi katerih je trava močnejša, bolj trpežna in se lahko upre težkim podnebjem. Ne samo to, živina raje raje olivijo z endofitom, kar kaže na to, da gliva daje dodatno hranilno vrednost ali okus, zaradi česar je kolonizirana trava privlačna za živali. Opravljene so bile številne študije, da bi preučili, kako rastejo gobe, kolonizirane z glivami, in da bi ugotovili razliko med kolonizirano in neokuženo olinico.
Raziskovalci se vedno zanimajo za prepoznavanje novih endofitov in spoznavanje njihovih učinkov na rastline, v katerih živijo. V primeru medsebojnih odnosov so endofiti lahko zelo dragoceno orodje za preživetje rastlin, ki so kolonizirane z njimi, saj organizem na nek način koristi rastlini. skozi kolonizacijo. Vrsta, ki deluje kot endofit, se lahko premika skozi rastlinsko populacijo na različne načine, odvisno od rastline in zadevnega organizma.
Bakterije in glive so najpogostejši endofiti. Oba sta dovolj majhna, da lahko udobno živita v gostiteljski rastlini, oba pa sta znana tudi po svoji prilagodljivosti in pripravljenosti izkoristiti situacije, ki so lahko koristne. Glive in bakterije lahko proizvajajo tudi vrsto izločkov, ki lahko vključujejo toksine in koristne spojine. Vzpostavitev vzajemnega odnosa je koristna za obe vrsti, saj povečuje njune možnosti za dolgoročno preživetje z zagotavljanjem, da sta tako endofitna kot kolonizirana rastlina sposobna preživeti v različnih okoljih.