Ekološki laboratorij je objekt, kjer ljudje študirajo ekologijo. Ekološki laboratoriji se lahko razlikujejo od terenskih lokacij, kjer se izvajajo dolgoročne študije, do fiksnih zgrajenih objektov, obremenjenih z znanstveno opremo, ki jo lahko ekologi uporabljajo za nadaljnje delo. Ekološki laboratoriji so pogosto povezani z univerzitetnimi in visokošolskimi ekološkimi programi, lahko pa so povezani tudi z vladnimi agencijami, zasebnimi podjetji in organizacijami za ohranjanje okolja.
Ekologija, ki preučuje način interakcije organizmov med seboj in naravnim okoljem, vključuje številna podpolja. Tako kot druge naravoslovne znanosti tudi ekologija združuje delo na tem področju, ki ljudem omogoča opazovanje in zbiranje vzorcev z delom v laboratoriju, kar ponuja možnosti za študij, eksperimentiranje in analizo za raziskovanje in potrditev ugotovitev in teorij, ki so jih razvili ekologi. Sposobnost dela v laboratoriju je ključnega pomena za mnoge ekologe, prav tako viri, ki so lahko na voljo ekološkemu laboratoriju, od opreme za teren do opreme za testiranje DNK.
Fiksni laboratoriji običajno vključujejo znanstveno opremo, ki se uporablja pri študiju ekologije, vključno z orodji za biokemične analize, mikroskopi, radiološko opremo in skladiščnimi prostori za vzorce. V ekološkem laboratoriju lahko ekologi naredijo vse, od seciranja rastlin, ki jih najdejo na terenu, do testiranja sumljivih tal na prisotnost radioloških onesnaževalcev. Sposobnost izvajanja kompleksne kemične analize je lahko koristna tudi za ekologe, ki delajo na različnih področjih, kot so vodni ekologi, ki se želijo seznaniti z vsebino vzorca vode.
Številne fiksne laboratorije imajo tudi prostore za eksperimentiranje. V laboratoriju lahko ekolog ustvari popolnoma nadzorovano okolje za izvedbo poskusa. Ekologi lahko uporabljajo in manipulirajo s potencialno nevarnimi predmeti tudi pri varovanju laboratorija, pri čemer raziskujejo teme, kot so vpliv jedrskih padavin na kmetijstvo, gensko spremenjene rastline ali posledica izpusta tujerodne vrste v ranljivem okolju. Sposobnost eksperimentiranja in testiranja je pomembna za raziskovalce, ki želijo pokazati, da so v celoti raziskali vprašanje v ekološkem laboratoriju.
Ekološki terenski laboratorij lahko vključuje kar koli, od začasnih objektov, ki jih ekologi uporabljajo za shranjevanje in obdelavo vzorcev v bližini raziskovalnega mesta, do območja v naravnem okolju, ki so ga raziskovalci namenili za uporabo kot ekološki laboratorij. Z delom na posebnem območju, ki je bilo namenjeno ekološkemu laboratoriju za študije, lahko ekologi raziskujejo naravno krajino in nadzorujejo različne vplive, kot je vpliv drugih ljudi na okolje.