Ekološka skuta je vrsta mehkega, svežega sira, ki je bil proizveden brez uporabe pesticidov, rastnih hormonov ali preventivnih antibiotikov. Sam sir je običajno narejen iz pinjenca, ki ga lahko ustvarimo kot naravni stranski produkt postopka izdelave masla ali s fermentacijo mleka. Priprava ekološke skute ne traja več kot en dan in jo je treba takoj porabiti ali pa nekaj tednov hraniti v hladilniku, da se ne pokvari.
Da bi izdelek označil kot ekološko skuto, mora sirar upoštevati niz smernic. Čeprav se posebnosti ekološkega certificiranja razlikujejo od države do države, je ena standardna zahteva, da se živali, ki se uporabljajo v postopku izdelave sira, hranijo z ekološkimi žiti. Ta zrna je treba gojiti na zemljiščih, ki so vsaj tri leta brez neekoloških pesticidov, herbicidov in gnojil. Živalim je treba omogočiti tudi naravno dozorevanje in jim ne smemo dajati hormonov ali neekoloških dodatkov za povečanje njihove stopnje rasti ali proizvodnje mleka. Poleg tega živalim ni mogoče dajati antibiotikov, razen če so bolne in potrebujejo veterinarsko zdravljenje.
Ekološko mleko, ki ga pridelajo živali, vzgojene v skladu s temi standardi oskrbe, se lahko uporabi za izdelavo ekološke skute. V večini primerov se pri tej vrsti sira uporablja kravje mleko, skuto pa je mogoče izdelati tudi iz mleka drugih mlečnih živali, kot so ovce ali koze. Med postopkom izdelave sira je treba ekološke sestavine hraniti ločeno od neekoloških sestavin, s katerimi lahko obdeluje tudi tovarna.
Postopek izdelave ekološke skute je enak postopku, ki se uporablja za izdelavo neekološke skute. Mleko, uporabljeno v siru, fermentira en dan ali manj, odvisno od tega, ali je uporabljen renin in želena velikost skute v siru. Nato ga počasi segrevamo, dokler se skuta ne strdi. Ko je skuta želene teksture, sirotko ali tekoči del mleka speremo in skuto pustimo, da se ohladi v hladilniku.
Na voljo so številne sorte ekološke skute. Lahko je narejen iz mleka različnih živali, od katerih bo vsaka proizvedla skuto z nekoliko drugačnim okusom. Prav tako ga lahko mešate s sadjem, marmeladami, zelišči ali začimbami, podobno kot je jogurt, za proizvodnjo aromatizirane skute.