Čiščenje protiteles je postopek, pri katerem se protitelesa ekstrahirajo iz antiseruma, ki vsebuje mešanico spojin. Ko so protitelesa očiščena, jih lahko uporabimo na različne načine. Ta postopek se lahko izvaja v laboratorijih, ki ponujajo storitev čiščenja protiteles, ljudje pa lahko čistijo tudi sami, če imajo potrebno opremo in orodja. To je mogoče storiti v laboratoriju, kjer ljudje želijo hitre preobrate za svoje raziskave, ali ko so raziskovalci zaskrbljeni zaradi zaščite celovitosti izvirnih raziskav.
Eden glavnih virov protiteles je antiserum, ki ga proizvajajo živali. V tem primeru se živali večkrat injicira z antigenom, dokler ne razvije protiteles, njena kri pa se uporabi za pripravo antiseruma, ki ga je mogoče očistiti za dostop do protiteles. Drug vir protiteles je klonirana celica, ki proizvaja protitelesa kot del kolonije identičnih celic; ta metoda se uporablja za množično proizvodnjo tako imenovanih »monoklonskih protiteles«.
Obstaja več tehnik, ki se lahko uporabljajo za čiščenje protiteles. Najprimernejša tehnika je odvisna od medija, ki se čisti. Protitelesa, proizvedena v jajcih, se na primer obravnavajo drugače kot protiserum iz zajca ali koze. Afinitetna kromatografija in protein A/G se uporabljata pri čiščenju protiteles z namenom izolacije protiteles iz preostale raztopine. Klasično čiščenje protiteles temelji na uporabi snovi, ki se veže na specifično protitelo in se zadrži na mestu, medtem ko se preostanek raztopine izpere.
Za raziskave bodo morda potrebne relativno majhne količine protiteles. V drugih primerih jih je treba ustvariti v velikih količinah, ker se uporabljajo v terapiji ali diagnostiki. Na primer, protitelesa je mogoče uporabiti s testom ELISA, da ugotovimo, ali je bil nekdo izpostavljen virusu ali ne. Test lahko razkrije, ali so v krvi prisotna ustrezna protitelesa in v kakšni koncentraciji, kar je lahko pomembno pri določanju resnosti in obsega okužbe. V tem primeru je potrebno imeti pri roki zadostne zaloge protiteles, da se izognemo zamiku pri testiranju.
Raziskovalci lahko naročijo protitelesa po meri prek podjetij, ki proizvajajo protitelesa. Ta podjetja pogosto zagotovijo celoten paket, ki raziskovalcu oskrbi prečiščena protitelesa ob koncu določenega časovnega obdobja. Stroški proizvodnje in čiščenja protiteles se razlikujejo, odvisno od podjetja in protitelesa, ki se proizvaja.