Obračun čekov je čas, v katerem banka obdela plačilo s čekom, bodisi papirnim ali elektronskim. Glede na velikost finančne institucije se lahko postopek obračuna čekov razlikuje. Končno se plačilo izvede s strankinega bančnega računa prejemniku plačila v trenutku, ko je ček potrjen.
Preden se ček lahko obračuna pri kateri koli finančni instituciji, mora imeti stranka odprt tekoči račun. Sredstva se črpajo s tega računa. Če zahtevani znesek denarja presega velikost računa, se lahko vrne ček za nezadostna sredstva in stranki se lahko zaračunajo provizije za prekoračitev. Nekatere banke ponujajo zaščito pred prekoračitvijo, ki omogoča potrditev čekov, tudi če sredstva niso na voljo. Zaščita pred prekoračenjem običajno vključuje omejitve in provizije, povezane s storitvijo.
Banke so za pomemben del dobička odvisne od prihodkov iz naslova prekoračitve. Te provizije predstavljajo največji del stroškov storitev na depozitnih računih za velike banke letno. Banka se še bolj zanaša na prihodke od nadomestil, ko so pod pritiskom prihodki iz drugih finančnih produktov, kot so hipoteke. Stranke imajo največje težave pri obračunu čekov v mesecu novembru, decembru in januarju. Visok odstotek teh pristojbin je ocenjen v tem časovnem obdobju, ker potrošniki običajno porabijo več denarja v prazničnem času.
V nekaterih regijah mora banka navesti pristop, ki ga uporablja za obračun čekov. Ena metoda je na primer obdelava čekov, ko pridejo, ne glede na vrednost čeka. Druga metoda, ki je zelo razširjena med velikimi bankami, je obdelava čekov na način od visoke do nizke. V tem procesu se preverjanje z najvišjo vrednostjo obdela pred katerim koli manjšim pregledom.
Če banka na isti dan prejme več čekov in skupna vsota združenih čekov presega znesek, ki je na voljo na bančnem računu stranke, lahko to povzroči opustošenje na računu. Banka, ki uporablja obračun čekov od visoke do nizke, bo najprej obdelala največji ček, ki mu sledijo manjši čeki v padajočem vrstnem redu. To poveča verjetnost, da bo na tekočem računu po obdelavi prvega velikega čeka prišlo do prekoračitve, kar bo povzročilo več provizij za prekoračitev za stranko, ko bo obdelan vsak manjši čeek.
Stranke lahko dostopajo do druge oblike obračuna čekov z debetno kartico. Debetna kartica deluje podobno kot ček, le da so transakcije običajno obdelane v času transakcije, kar bi lahko zmanjšalo provizije za prekoračitev. Pri transakciji na tekočem računu se sredstva črpajo, ko banka prejme ček, kar je lahko nekaj dni po opravljenem nakupu.