Čebulni pire naredimo tako, da čebulo predelamo ali pretlačimo, dokler ne nastane pasta ali gosta juha. Metode, ki se uporabljajo za pripravo čebulnega pireja, segajo od zelo preprostih, pri katerih čebulo skuhamo in nato prestavimo v kuhinjski robot, do zelo zapletenih, pri čemer se čebula in dodatne začimbe kuhajo ure in ure, preden se končno pretlači. Dokončan čebulni pire lahko uporabimo kot začimbo pri kuhanju, kot začimbo za meso, kot prilogo ali pa ga spremenimo v glavni obrok, ki spominja na juho ali enolončnico. V nekaterih vrstah azijske kuhinje, vključno z indijsko kuhinjo, se pogosto uporablja čebulni pire, ker ima zelo malo teksture in se lahko hitro popeče v ponvi, ko je pire. Eden od načinov, kako ohraniti čebulni pire, je, da ga kombinirate s česnom ali mešanico česna in ingverja ter ga oblikujete v zamrznjene kocke ali bloke za kasnejšo uporabo.
Ni treba kuhati vsega čebulnega pireja, preden ga prelijete v mešalnik, malto s pestičem ali mlin za hrano. Surovo čebulo lahko nasekljamo na majhne koščke in zmešamo z neko vrsto tekočine (običajno je voda, belo vino ali oljčno olje) in nato obdelamo, dokler ne nastane gladka pasta. Pire iz surove čebule je zelo pekoče, vendar se lahko v vroči ponvi hitro karamelizira. V tej obliki se pire zamrzne in enostavno ohladi za shranjevanje.
Bolj aromatičen čebulni pire lahko naredite tako, da čebulo v ponvi s težkim dnom združite s črnim poprom, baziliko, timijanom, rožmarinom, komarčkom in začimbami. Včasih dodamo tudi belo vino, kis, govejo juho, česen, strok in kosmiče rdeče paprike. Sestavine običajno dušimo na maslu, da zadišijo, nato pa dodamo nekaj vode ali drugih tekočin. Celotno mešanico pustimo počasi kuhati nekaj ur, da se okusi zlijejo, čebula postane čim bolj mehka in večina tekočine se zmanjša. Ko je mešanica končana, se zmes pretlači in, odvisno od sestavin in želene teksture, jo lahko prelijemo skozi sito, da odstranimo večje delce.
Različice čebulnega pireja uporabljajo povezane aromatične snovi, ki dopolnjujejo okus čebule; med njimi so šalotka, česen in zelena čebula. Čebulo lahko tudi dimimo, pečemo na žaru, karameliziramo ali pražimo, preden jo skuhamo in pretlačimo, da dobimo drugačen splošni okus jedi. Pire lahko naredite zelo kremast z dodajanjem kakšne vrste zgoščevalca, kot je koruzni škrob, koruzni zdrob, debela smetana ali kuhana moka in maslo.