Čebulno juho lahko pripravimo na več različnih načinov, čeprav se običajno začne s čebulo, ki je karamelizirana. Za pripravo juhe se pogosto uporablja piščančja in goveja juha, običajno z belim ali rdečim vinom, ki se doda za popolno juho. V juhi običajno postrežemo velik kos popečenega kruha, ki daje nekaj kontrastnega okusa in daje dodatno teksturo, saj med jedjo vpije juho. Čebulno juho običajno prelijemo s sirom, pogosto Gruyere, in postavimo pod peč, da se sir stopi in porjavi.
Imenuječna sestavina čebulne juhe običajno služi kot začetek te jedi, čeprav se lahko zaloga ali juha pripravi nekaj dni ali tednov pred časom za uporabo v njej. Za pripravo je mogoče uporabiti skoraj vse vrste čebule, čeprav so zaradi bogatejšega okusa priljubljene slajše sorte, kot sta rumena in rdeča. Čebulo narežemo na dokaj tanke rezine, pogosto v obliki polmeseca, in skuhamo v loncu z nekaj masla. Pravilno karameliziranje te čebule lahko zahteva pol ure ali celo uro kuhanja, da zagotovimo, da dobijo rjav videz in sladkost, ki daje čebulni juhi globok okus.
Te čebule nato zmešamo z juho ali juho, da tvorijo osnovo čebulne juhe. Tako piščančja kot goveja juha se dobro obneseta; nekateri kuharji raje uporabljajo samo enega od njih, drugi pa oboje skupaj vključijo v en sam recept. Dodamo dodatne arome, kot so jabolčni jabolčnik, vino in različna zelišča, in to kuhamo, dokler čebulna juha ne dobi ustrezne konsistence in okusa. Uporabite lahko rdeče ali belo vino, ki običajno temelji na osebnih željah.
Postrežba čebulne juhe je pogosto glavni element pri njeni pripravi, zlasti v tradicionalnih storitvah, kjer jo z žlico nalijemo v majhne posode, primerne za pečico. Na vrh juhe položimo velik kos popečenega kruha, ki začne vpijati bogat okus juhe. Tega prelijemo z naribanim ali naribanim sirom, običajno gruyerskim ali švicarskim, in postavimo v pečico pod pivnico. Sir se stopi in porjavi na čebulni juhi in lončku, ki je, in ga postrežemo neposredno iz pečice. Uživanje juhe običajno vključuje nekaj kruha in sira v vsakem grižljaju z juho in čebulo, kar zagotavlja široko paleto okusov in tekstur v vsaki žlici.