Biološka vojna, imenovana tudi vojna z mikrobi, je uporaba škodljivih mikroorganizmov, kot so virusi ali bakterije, s strani vojaških frakcij ali teroristov proti civilistom, nasprotujočim si vojskam, pridelkom ali živalim. Organizmi, ki se uporabljajo, lahko delujejo tako, da proizvajajo škodljive strupe ali toksine pred ali po odpremi. Morda ne bo treba sprostiti velike količine biološkega orožja, saj lahko nekatere vrste smrtonosnih sredstev ubijejo celo milijone ljudi s sproščanjem le v sledovih.
Biološko vojskovanje lahko vojaška oprema ali drugi ljudje s škodljivimi nameni uporabljajo na več različnih načinov. Najpogostejša percepcija uporabe bioloških sredstev je, da so namenjena ubijanju velikih količin vojakov in civilistov, vendar obstaja veliko načinov, kako jih je mogoče uporabiti. Manj škodljivih mikrobov bi lahko porazdelili med sovražnikove vojake, da bi bili preveč bolni za boj. Druga učinkovita uporaba mikroorganizmov je njihova uporaba za ubijanje ali poškodovanje sovražnikovih pridelkov hrane z namenom, da se prekine njihova oskrba s hrano, kar lahko vključuje živino in glavne osnovne prehrambene izdelke rastlinskega izvora.
Leta 1969 je v ZDA nekdanji predsednik ZDA Richard M. Nixon izjavil, da država ne bo več uporabljala biološke vojne proti drugim državam. Ta vrsta boja je bila prepovedana z mednarodno pogodbo leta 1975, vključuje pa tudi posedovanje in proizvodnjo biološkega orožja. Vendar pa morajo vojaški strategi do danes še vedno upoštevati morebitno nezakonito uporabo biološkega vojskovanja s strani sovražnika. Zaradi tega v znanstvenem svetu potekajo nenehne raziskave, ki so namenjene obrambi pred številnimi scenariji bioloških napadov. Sem spadajo teroristični napadi, imenovani tudi bioterorizem, ki se lahko zgodijo kjer koli in kadar koli.
Da bi bilo biološko orožje učinkovito, mora biti sposobno potovati hitro in po širokem območju. Prav tako mora biti težko popraviti. Na primer, če gre za bolezen, mora biti cepivo težko dostopno ali sploh ne obstaja. Antraks je vrsta biološkega boja, ki bi se, če je bila pravilno proizvedena, lahko razširila po zraku na velikem območju in dokaj hitro okužila svojo tarčo. Ker se učinki antraksa ne prenašajo med ljudmi ali živalmi z običajnimi sredstvi, kot je dihanje, se lahko antraks zlahka omeji na ciljno območje. Vendar pa je to območje lahko zelo veliko in bo ostalo onesnaženo še dolgo po sprostitvi orožja zaradi povečane moči onesnaževalca, ki je bil izdelan posebej kot biološko orožje.
Druga sredstva, ki so bila uporabljena ali načrtovana kot biološka vojna proti ljudem, so kolera, črne koze in rumena mrzlica, če naštejemo le nekatere. Ker obstaja toliko vrst, morajo biti tisti, ki se ukvarjajo z obrambo pred biološkimi napadi, pripravljeni čim prej s širokim naborom metod prepoznati vrsto klic ali toksinov. Toksini in strupi, ki jih proizvaja biološko orožje, se pogosto štejejo tudi za vrste kemičnega boja. Obstaja veliko raziskav, ki se izvajajo na obeh področjih biološkega in kemičnega bojevanja hkrati, saj sta lahko tako tesno povezana.