Bakterijski filter je filtrirna naprava ali vložek, ki preprečuje prehajanje organizmov nad določeno velikostjo in omejuje gibanje večine bakterij. Takšni filtri so uporabni pri dovodih zraka in drugih napravah, ki lahko pridejo v stik z bolnimi bolniki, kot so spirometri, ki se uporabljajo pri ocenjevanju zmogljivosti pljuč. Prodajajo jih znanstveni in medicinski dobavitelji, včasih pa so na voljo v trgovinah s strojno opremo in na podobnih lokacijah.
Učinkovitost bakterijskega filtra je odvisna od velikosti delcev, ki lahko potujejo skozi njega. Na embalaži mora biti navedena stopnja zagotovljene filtracije. Zagotavlja lahko meritev in oceno, kolikšen odstotek organizmov naj filter uspešno blokira. Oblikovalci morajo najti ravnotežje, ko gre za razvoj bakterijskih filtrov. Če filter ni dovolj porozen, zrak in drugi materiali morda ne bodo krožili, če pa je preveč porozen, lahko bakterije prehajajo skozi.
Klimatske naprave in dovod zraka imajo pogosto bakterijski filter. Filter preprečuje, da bi bakterije prešle v čisto območje in bo varoval ljudi. V znanstvenih laboratorijih, kjer lahko raziskovalci ravnajo z nevarnimi organizmi, nape in zračniki nad delovnimi postajami uporabljajo tudi filtracijo, da preprečijo uhajanje mikroorganizmov. Če se katera zrahlja, se ujame v filter, preden lahko doseže zunanjost.
Na medicinskih napravah, kot so spirometri, dihalne maske in podobno, bakterijski filtri omejujejo širjenje mikroorganizmov med bolniki. Lahko so za enkratno ali večkratno uporabo, odvisno od sistema. Sistem ima običajno režo za kartušo ali list, poleg tega pa je mogoče poleg tistih, ki jih priskrbi proizvajalec, uporabiti tudi standardne izdelke za bakterijske filtre. Filtri za večkratno uporabo imajo lahko indikatorski trak, ki opozori operaterja, ko bo bakterijski filter kmalu potekel, ali pa ga je mogoče zamenjati po urniku v skladu z uporabo.
Takšni filtri so uporabni tudi na vodnih črpalkah in drugih sistemih za filtriranje tekočin. Bakterije in drugi mikroorganizmi se lahko kopičijo v rezervoarjih, rezervoarjih in podobnih okoljih. Filtracija lahko prepreči širjenje med posode in lahko tudi omeji prodiranje bakterij v vodovodne in komunalne oskrbe z vodo. Bakterijski filtri so lahko zelo uporabni tudi za dejavnosti, kot sta priprava piva in vina, kjer je za olajšanje fermentacije potrebno imeti prezračevanje, vendar pivovar ali vinar ne želi, da bakterije in drugi nevarni organizmi kontaminirajo serijo v rezervoarju.