Bakterijska fiziologija je preučevanje struktur in funkcij, ki bakterijam omogočajo preživetje. To vključuje vse, od sestave bakterijskih celičnih sten do encimov, ki jih lahko proizvedejo za izvajanje različnih notranjih in zunanjih funkcij. Raziskovalci na tem področju lahko delajo v laboratorijskih okoljih, raziskujejo znane organizme in se učijo več o novih bakterijah. Farmacevtska podjetja, okoljske agencije in številne druge organizacije uporabljajo bakterijske fiziologe.
Bakterije so izjemno raznolike in del dela bakterijske fiziologije vključuje razvoj smiselnih kategorij, na katere jih razdelimo za namene klasifikacije in raziskovanja. Raziskovalci lahko na primer razdelijo organizme na Gram pozitivne in negativne bakterije glede na to, kako reagirajo na obarvanje po Gramu. Prav tako jih lahko razdelimo na anaerobne bakterije, ki ne potrebujejo kisika za preživetje, na aerobne bakterije in organizme, ki se lahko preklapljajo naprej in nazaj in ne potrebujejo izključno oksigeniranega ali deoksigeniranega okolja. Bakterije lahko kažejo tudi različne stopnje gibljivosti in drugih značilnosti, ki lahko pomagajo raziskovalcem, da jih prepoznajo.
Raziskovalci bakterijske fiziologije gledajo na bakterijsko genetiko in kako se bakterije odzivajo na evolucijske pritiske. Zaporedjajo in preučujejo encime, ki jih proizvajajo bakterije. To vključuje strukture, potrebne za celične funkcije, kot je delitev, kot tudi bakterijske encime, ki se lahko sproščajo v okoliško okolje. Nekateri od teh so strupeni in lahko igrajo vlogo pri bakterijskih okužbah in kontaminaciji. Nekateri se osredotočajo posebej na nalezljive bolezni in interakcije med bakterijami in drugimi organizmi.
Drugi raziskovalci lahko raziskujejo teme, kot je simbioza, kjer bakterije živijo skupaj ali z drugimi organizmi v obojestransko korist. Nekateri lišaji imajo na primer bakterije kot simbiotske partnerje za oskrbo organizma z energijo, da lahko raste in se razmnožuje. Druge bakterije lahko živijo parazitsko na drugih organizmih in se lahko zanesejo nanje kot prehransko podporo. Nekateri od teh zajedavcev v zameno nudijo koristi, kot so organizmi v prebavnem traktu, ki pomagajo pri prebavi, drugi pa se lahko obrnejo na svoje gostitelje in povzročijo bolezen.
Študenti, ki jih zanima bakterijska fiziologija, bodo morali obiskovati tečaje biologije in nadaljevati usposabljanje posebej o bakterijah. Veliko ljudi na tem področju ima visokošolske diplome in raziskovalne kredite. Zaposlitvene možnosti so precej spremenljive. Lokacija, kjer želi znanstvenik delati, je lahko pomembna, prav tako področje specialnosti. Raziskovalci, ki delajo na temah, kot je uporaba bakterij za izdelavo farmacevtskih izdelkov, lahko na primer naredijo več kot ljudje, ki opravljajo osnovne raziskave fiziologije bakterij.