Bakterijska beljakovina je beljakovina, ki je bodisi del strukture bakterije ali pa jo proizvaja bakterija kot del svojega življenjskega cikla. Beljakovine so pomemben del vseh živih organizmov in bakterije niso izjema. Zahvaljujoč dejstvu, da je veliko bakterij enostavno kultivirati v laboratoriju, je bilo opravljenih veliko raziskav o bakterijskih beljakovinah, da bi izvedeli več o specifičnih beljakovinah in njihovih funkcijah. Razumevanje bakterijskih beljakovin je pomembno, ker imajo bakterije zelo aktivno vlogo pri zdravju ljudi in ker je informacije mogoče ekstrapolirati za zbiranje več podatkov o beljakovinah, povezanih z večjimi organizmi, vključno z ljudmi.
Beljakovine so dolge verige aminokislin, ki se zložijo nazaj nase. Narava beljakovin je določena tako z verigo aminokislin kot z načinom zlaganja beljakovin. Beljakovine so kodirane v genih, pri čemer se nekatere beljakovine izražajo med razvojem organizma, druge pa jih proizvaja organizem z namenom izpolnjevanja določenih nalog. Genetska koda organizma vsebuje načrte za številne beljakovine.
Poleg tega, da je edinstvena struktura, ima bakterijski protein tudi sposobnost, da se veže z drugimi beljakovinami. Vezava na beljakovine vključuje nastanek zelo močnih povezav med dvema različnima beljakovinama. Ko se beljakovine vežejo, lahko sprožijo reakcijo, ki se lahko razlikuje od odziva imunskega sistema na okužbo do začetka bolezni. Sčasoma so se številne bakterije razvile, da proizvajajo beljakovine, ki ciljajo na določene lokacije na človeških in živalskih celicah.
Bakterijske beljakovine so za ljudi zanimive iz več razlogov. Razumevanje, kateri proteini so vključeni v strukturo določenih bakterij, lahko pomaga raziskovalcem razviti zdravila, ki identificirajo in ciljajo na določeno bakterijsko beljakovino, kar omogoča raziskovalcem, da ustvarijo protibakterijska zdravila, ki ciljajo na določene organizme. Razumevanje posameznih beljakovin lahko raziskovalcem omogoči tudi spremljanje mutacij in spremljanje načinov, na katere so se te mutacije pojavile, in kako jih je mogoče obravnavati.
Nekatere bakterije proizvajajo beljakovine, ki imajo škodljiv učinek na človeško telo. Bakterijska beljakovina je lahko strupena in povzroči bolezen ali smrt v organizmu, ki je bil okužen z bakterijo, bakterijske beljakovine pa se lahko tudi vežejo s specifičnimi beljakovinami v telesu in povzročijo različne simptome. Raziskovalci lahko porabijo leta za identifikacijo vseh beljakovin, povezanih z eno samo vrsto bakterije, in ta proces je lahko zapleten zaradi hitrih mutacij, kot je razvidno v primeru zvite bakterije Staphylococcus.