Veja antropologije, znana kot arheologija spolov, si prizadeva za nadaljnje razumevanje vlog moških in žensk v starodavnih človeških kulturah. Ustanovitelji te veje arheologije trdijo, da arheologinja spolov zahteva višjo stopnjo dokaza, preden oblikuje teorije ali pride do zaključkov. Metodologije, ki se uporabljajo pri pregledovanju grobišč, lahko vključujejo skeletno, kemično in mikroskopsko analizo; poglobljene preiskave pogrebnih artefaktov; in primerjalne študije drugih grobnic. Nekateri verjamejo, da se je arheologija spolov začela s feminističnim gibanjem in trdijo, da se je študija pojavila v poskusu povišanja vloge žensk v zgodovini človeštva. Zagovorniki arheologije spolov trdijo, da konvencionalne kulturne študije pogosto napačno razlagajo podatke, ki temeljijo na vnaprej oblikovanih idejah.
Številne običajne predstave v antropoloških študijah kažejo, da imajo moški prevladujoč politični, verski in družbeni položaj. Arheologija spolov raje preučuje zgodovino na podlagi fizičnih dokazov, ne pa s samodejno dodeljevanjem vlog na podlagi bioloških spolnih lastnosti. Mnogi so predlagali, da bi moški, ki naj bi bili fizično močnejši od samic, oblikovali orodja in sprejeli odgovornost lova in boja, medtem ko so bile ženske odgovorne za vzgojo otrok, zbiranje in tipične gospodinjske obveznosti. Na podlagi artefaktov in skeletnih dokazov novejši arheološki dokazi kažejo, da so v nekaterih kulturah moški sodelovali pri vzgoji otrok in drugih domačih obveznostih ter da so ženske ustvarjale orodja.
Starodavne kulture so pogosto pokopavale moške, ki so ležali na desni strani z glavo obrnjeno proti vzhodu ali severu, medtem ko so bile ženske postavljene na levo stran z glavo obrnjeno proti jugu ali zahodu. Arheologi so pogosto razvrščali spol posmrtnih ostankov na podlagi položaja pokopa, dokler se arheologija spola ni poglobila z izvajanjem testiranja deoksiribonukleinske kisline (DNK) na ostankih. Nekatera telesa, za katera so prvotno mislili, da so ženske, so bila v resnici moška.
Preiskava pogrebnih artefaktov v več kulturah je pokazala, da so nekatere družbe verjele v tretji spol ali v posameznike dveh duhov, ki so pogosto delovali kot pogrebniki, šamani ali drugi zelo prestižni verski voditelji v skupnosti. Med nekaterimi preiskavami so telesa, okrašena z nakitom, prvotno veljala za ženske. Nadaljnja raziskava je pokazala, da sta oba spola v nekaterih kulturah nosila nakit in da sta število in postavitev okraskov natančneje določala spol posameznika.
V nekaterih družbah so ženske s staranjem pridobile status. Arheologinja spolov, ki je preučevala celotno pokopališče, je odkrila, da so ženske, ki so se starale v določenih skupnostih, družbe pokopale z bolj ekstravagantnimi oblačili in artefakti. Gender arheologija je tudi odkrila, da moški različnih kultur nimajo vedno politične in družbene moči. Artefakti in ostanki v grobnici, odkriti sredi Evrope in datirani v okoli 500 pr.n.št., so razkrili pokopališče možne princese. Še ena obsežna grobnica, najdena v Koreji, datirana okoli 400 AD, kaže na zadnje počivališče kraljice.