Antibakterijski šampon je vrsta detergenta, ki vsebuje kemikalije, ki ubijajo bakterije. Za razliko od antibakterijskih mila je posebej zasnovano za uporabo na človeških laseh ali živalskem krznu. Čeprav so zdravilne lastnosti usmerjene v kožo, so čistilne lastnosti šampona zasnovane tako, da delujejo na laseh in krznu. Obstaja številna antibakterijska sredstva, ki se lahko uporabljajo v antibakterijskih šamponih, in najboljši tip šampona za uporabo bo odvisen od razloga, zaradi katerega je šampon predpisan.
Tako kot druge vrste šamponov je tudi antibakterijski šampon narejen za čiščenje las in kože pod njimi. Čeprav je za umivanje las mogoče uporabiti običajno milo, je lahko težko izprati milo, zato večina ljudi raje uporablja šampone, ki so posebej oblikovani za čiščenje umazanije in olja z las in jih nato popolnoma sperejo. V kombinaciji z antibiotikom se lahko šampon uporablja za čiščenje las in za pomoč pri odstranjevanju bakterijskih okužb na koži.
Pri ljudeh se antibakterijski šampon pogosto uporablja za pomoč pri zdravljenju aken na lasišču. Običajna sredstva za pranje aken so narejena za uporabo na koži, vendar lahko poškodujejo lase, če se uporabljajo na glavi. Posebno oblikovan šampon proti aknam je varen za uporabo, ko poskušate očistiti lasišče aken. Ti šamponi vsebujejo enega ali več antibiotikov, kot sta metilkloroizotiazolinon ali salicilna kislina, ki pomaga ubiti bakterije, ki bi lahko prodrle v pore in tvorile mozolje.
Ljudje lahko uporabljajo to vrsto šampona tudi za pomoč pri zdravljenju stafilokoknih okužb, ki se lahko pojavijo na lasišču. V večini primerov je treba okužbe, kot so te, zdraviti s peroralnim antibiotikom in lokalnim antibakterijskim šamponom. Vsako okužbo kože mora pregledati zdravnik, ki lahko določi najboljšo vrsto antibiotika za boj proti okužbi.
Tudi veterina uporablja antibakterijske šampone, zlasti pri zdravljenju vnetja pri psih. Glede na resnost kožne okužbe lahko veterinar predpiše antibiotične tablete, antibiotično mazilo in antibiotični šampon. Šampon pomaga pri odpravljanju bakterijskih okužb, ki so bolj razširjene na koži živali, saj je pri kopanju v šamponu z antibiotiki lažje nanesti antibakterijsko sredstvo po žival. Jod, benzoil peroksid in klorheksidin acetat so vsi običajno uporabljeni antibakterijski agensi v veterinarskih antibakterijskih šamponih.