Antibakterijski izdelki sicer pomagajo nadzorovati bakterijske okužbe, vendar so raziskave pokazale, da lahko bakterije ustvarijo odpornost na te izdelke, če jih uporabljamo preveč ali po nepotrebnem. Mnogi ljudje se prodajajo z idejo, da bi jih uporabili zaradi njihove sposobnosti ubijanja klic in bakterij. Ko se ti izdelki uporabljajo za preprečevanje neobstoječih bakterij v domu namesto za uničenje tistega, kar je že tam, lahko, ironično, ustvarijo več bakterij, kot naj bi jih zmanjšali.
Nekatere bakterije vsebujejo gen, ki je sam po sebi odporen na določene antibiotike. Zato lahko antibakterijski izdelki, namesto da uničijo bakterije, celo povzročijo povečanje nekaterih sevov. Druge bakterije imajo celice, ki lahko odstranijo antibakterijsko sredstvo v procesu, imenovanem iztočna črpalka. Celica se upre protibakterijskemu sredstvu tako, da ga izprazni stran od sebe.
Antibiotiki so narejeni tako, da dejansko ubijajo bakterije, vendar so antibakterijski izdelki namenjeni le preprečevanju njihovega širjenja. Takšni izdelki vključujejo milo, gel in razkužilo ter gospodinjska čistila. Težava pri uporabi teh predmetov za preprečevanje klic, ki niso prisotne, je v tem, da lahko bakterije mutirajo, da se uprejo protibakterijskim kemikalijam.
Poleg tega, tudi če so prisotni mikrobi in se za njihovo uničenje uporablja antibakterijsko milo, si večina ljudi ne umiva rok dovolj dolgo ali pri temperaturi, ki je potrebna za učinkovito delovanje mila. Pogosto je treba uporabiti pravo količino mila in pravo količino vode, domači izdelki pa to le redko upoštevajo.
Triklosan je glavno antibakterijsko sredstvo, ki ga najdemo v antibakterijskih izdelkih, študije pa so pokazale, da se ne znebi vseh bakterij. Antibakterijska sredstva, kot je ta, lahko ubijejo najšibkejše bakterije, medtem ko se najmočnejše bakterije razmnožujejo. To bi lahko sčasoma povzročilo nastanek “super hroščev”, ki postanejo odporni na izdelke, ki bi jih morali ubiti.
Znanstvene študije so pokazale vsaj nekaj korelacije med »preveč čistimi« domovi, očiščenimi z antibakterijskimi izdelki, in povečanimi alergijami pri otrocih. Te študije kažejo, da lahko prekomerna uporaba antibakterijskih sredstev vpliva na imunski sistem in če se prepogosto uporablja na koži, lahko povzroči celo več primerov nekaterih kožnih bolezni. Nekateri dermatologi poudarjajo, da lahko preveč antibakterijskega mila izsuši kožo, suha koža pa pogosto povzroči dovzetnost za odprte rane. Odprte rane pustijo kožo ranljivo za bakterije. Če uporabljate običajno milo, namesto antibakterijsko, se lahko izognete težavi.