Težko je ugotoviti, ali je katero koli zdravilo 100-odstotno varno za uporabo med nosečnostjo in kodein ni izjema. Študije uporabe kodeina med nosečnostjo niso izključile tveganja vpliva na dojenčke v razvoju. Na splošno se zdravniki izogibajo predpisovanju zdravila, razen če ugotovijo, da koristi uporabe zdravila odtehtajo možna tveganja, ki jih ženska sprejme, ko ga jemlje. Glavna od teh tveganj sta lahko zaostajanje v rasti in odvisnost ploda od zdravila. Obstaja tudi možnost, da bo plod utrpel odtegnitvene simptome, ko njegova mati preneha jemati zdravilo.
Na splošno zdravniki med nosečnostjo neradi predpisujejo zdravila. To je posledica dejstva, da je težko vedeti, ali bo celo blago zdravilo povzročilo prirojeno okvaro ali kako drugače negativno vplivalo na plod. Vendar pa zdravniki predpisujejo kodein med nosečnostjo, ko ugotovijo, da bodo koristi za bodočo mater večje od tveganj za plod. Na primer, če ženska trpi zaradi zmerne do hude bolečine, lahko zdravnik predpiše kodein, da jo lajša. V nekaterih primerih zdravniki predpišejo tudi kodein za pomoč pri zatiranju kašlja.
Varnost kodeina med nosečnostjo je negotova, ker ni bilo dovolj nadzorovanih študij, da bi ugotovili, ali predstavlja resno tveganje za otroka v razvoju ali ne. Zdi se, da je glavni potencial tveganja za uporabo kodeina med nosečnostjo odvisnost. Kodein lahko povzroči odvisnost ne samo pri bodoči materi, ampak tudi pri njenem otroku v razvoju. Poleg tega obstaja zaskrbljenost, da lahko uporaba kodeina med nosečnostjo povzroči upočasnitev rasti ploda. Dejansko lahko uporaba kodeina celo povzroči, da ima plod odtegnitvene simptome, ko ga bodoča mati preneha jemati.
Če zdravnik ugotovi, da potreba bodoče matere po zdravljenju odtehta tveganje za jemanje kodeina med nosečnostjo, ji lahko predpiše zdravilo, pri čemer bo pozoren pri odmerjanju. V večini primerov bo predpisal najnižji odmerek, ki ji bo olajšal bolečino ali zatrl njen kašelj; manjši odmerek lahko pomaga zmanjšati tveganje za otroka. Prav tako ji lahko priporoči, da preneha jemati zdravilo, takoj ko se njeni simptomi umirijo ali postanejo bolj znosni. Ko bodoča mati enkrat rodi, je lahko uporaba kodeina manj zaskrbljujoča. Čeprav lahko zdravilo prehaja skozi materino mleko, uporaba kodeina med dojenjem ni povezana z visoko stopnjo tveganja.