Ena od težav pri uporabi ciprofloksacina in dojenju so mešana priporočila o uporabi zdravila pri doječih materah. Nekateri zdravstveni strokovnjaki pravijo, da ciprofloksacin predstavlja minimalno tveganje med dojenjem, medtem ko drugi ne priporočajo zdravila, ko ženska doji otroka. Omejene študije so pokazale, da antibiotik prehaja v materino mleko, vendar se ravni razlikujejo. Raziskave so pokazale, da lahko ciprofloksacin poškoduje kosti in sklepe potomcev pri živalih.
Znanstveniki so v eni študiji testirali kri dojenih otrok, katerih matere so jemale ciprofloksacin. Višje ravni zdravila so bile zabeležene približno dve uri po tem, ko so ženske prejele peroralne odmerke zdravila. Skupna količina ciprofloksacina v serumu za dojenčke, izmerjena nižja od odmerkov, ki so običajno predpisani za dojenčke z določenimi boleznimi. Ko so znanstveniki testirali kri enega otroka, katerega mati je 10 dni kombinirala ciprofloksacin in dojenje, se ni pokazala nobena merljiva količina zdravila.
Negotovost in mešani znanstveni rezultati so pripeljali do tega, da je večina pediatrov predlagala alternativna antibiotična zdravila za doječe matere. Ameriška akademija za pediatrijo je ocenila, da sta ciprofloksacin in dojenje verjetno varna, razen če otrok trpi zaradi posebnega pomanjkanja encima, ki bi lahko oslabil sklepe. Družinska anamneza motnje lahko povzroči tudi večje tveganje za nekatere dojenčke.
Ciprofloksacin zdravi bakterijsko okužbo z blokiranjem encima, ki je potreben za razmnoževanje bakterij. Zdravilo uniči širok spekter bakterij in običajno deluje na klice, odporne na druga antibiotika. Predstavlja običajno zdravljenje okužb sečil, črevesnih parazitov in pljučnih okužb, vključno s pljučnico in bronhitisom. En odmerek ciprofloksacina deluje tudi pri zdravljenju gonoreje.
Čeprav obstajajo opozorila glede ciprofloksacina in dojenja, se zdravilo lahko daje majhnim otrokom z okužbami sečil, ki se ne odzivajo na druga zdravila. Otroci lahko to zdravilo jemljejo tudi za salmonelo in okužbe po kemoterapiji. Kemično zdravljenje raka običajno zmanjša delovanje imunskega sistema telesa z uničenjem zdravih krvnih celic, kar vodi v večje tveganje za okužbo.
Najpogostejši neželeni učinek tega zdravila vključuje slabost, ki lahko povzroči bruhanje, drisko in krče. Manj pogosti neželeni učinki se lahko pojavijo kot šibkost in utrujenost, pri čemer nekateri bolniki poročajo o omotici in izgubi apetita. Lahko se razvije tudi izpuščaj, zlasti pri ljudeh, alergičnih na zdravilo.
Bolniki, ki jemljejo ciprofloksacin, naj se izogibajo mleku in zdravilom, ki vsebujejo kalcij, magnezij in cink. Ti minerali lahko preprečijo absorpcijo zdravila v krvni obtok. Prav tako se morajo izogibati pretirani izpostavljenosti sončni svetlobi, ker lahko zdravilo poveča občutljivost na škodljive žarke in povzroči izpuščaj. Zdravniki običajno priporočajo bolnikom, da med uporabo zdravila povečajo vnos tekočine, da preprečijo nastanek kristalov v urinu.