Klindamicin je antibiotik, ki na splošno velja za varnega med nosečnostjo, zlasti če upoštevamo, da lahko nekatere nezdravljene okužbe povzročijo prezgodnji porod. Zdravniki najpogosteje predpisujejo klindamicin med nosečnostjo, da odpravijo nevarnost bakterijske vaginoze in okužb v maternici ali plodovem tkivu. Ameriška agencija za hrano in zdravila (FDA) je to zdravilo uvrstila v kategorijo nosečnosti B, ker študije ne kažejo škodljivih učinkov na živalske plodove. Po drugi strani pa je znano, da to zdravilo prehaja skozi placento in zaradi študij, opravljenih na ljudeh, ki niso zadostne za potrditev njegove varnosti, ga je treba uporabljati le, če zdravnik meni, da njegove koristi odtehtajo vsa tveganja za žensko in plod.
Bakterijska vaginoza je pogosta okužba, ki jo je običajno treba zdraviti med nosečnostjo, saj lahko škoduje plodu. Glavna tveganja vključujejo povečano verjetnost prezgodnjega poroda in nizko porodno težo. Medtem ko jemanje klindamicina lahko zdravi okužbo, je to stanje pogosto asimptomatsko, zato se lahko ženske, ki so nagnjene k prezgodnjim porodom, testirajo na to kljub pomanjkanju simptomov. To kaže, kako nevaren je lahko, če ga ne zdravimo, in zakaj je klindamicin v nosečnosti pogosto potreben, ko je diagnosticirana bakterijska vaginoza.
To zdravilo se včasih uporablja tudi za zdravljenje okužb v fetalnem tkivu ali maternici, ker lahko prehaja skozi posteljico. Po drugi strani pa lahko zdravniki počakajo do rojstva otroka, da zdravijo določene okužbe pri materi, če so le-te manjše in ne predstavljajo nevarnosti za mater ali otroka. Na primer, malo verjetno je, da bi zdravniki uporabljali klindamicin med nosečnostjo za zdravljenje aken, ker tveganja tega stanja običajno ne odtehtajo tveganja večine zdravil med nosečnostjo. Namesto tega lahko počakajo, da se otrok rodi, ali izberejo antibiotik, ki je bil ustrezno raziskan pri ljudeh.
Čeprav študije na živalih ne kažejo povečanega tveganja za prirojene okvare pri uporabi klindamicina v nosečnosti, zaradi česar je v kategoriji nosečnosti B, ga je treba še vedno uporabljati previdno. To je zato, ker študije, opravljene na ljudeh, niso bile dovolj nadzorovane, da bi določili natančen učinek na človeške plodove. Da bi bili na varni strani, mnogi zdravniki to zdravilo predpisujejo le v drugem trimesečju, kar lahko zmanjša tveganje za spontani splav ali prirojene okvare. Poleg tega je treba opozoriti, da se to zdravilo v majhnih količinah pojavlja v materinem mleku, zato doječim materam svetujemo, da počakajo nekaj ur pred dojenjem, če morajo jemati to zdravilo.