Zaporniška ladja je pomorsko plovilo, ki se uporablja za prevoz ali nastanitev obsojencev, državnih sovražnikov ali političnih disidentov. Te ladje, ki so jih običajno naročile države v vojni v tujih deželah, so bile priročen način za zadrževanje nezaželenih ljudi brez stroškov, da bi morali vzpostaviti stalni objekt na kopnem. Zaporniške ladje so bile pogosto predelane ladje, ki jih je prej uporabljala mornarica države.
Zgodovinsko gledano so bile zaporniške ladje priljubljene v Veliki Britaniji med ameriško vojno za neodvisnost kot prostori za zadrževanje ujetih uporniških vojakov. Velika Britanija je uporabljala tudi zaporniške ladje za prevoz obsojencev v kazenske kolonije na drugih celinah. Nacisti so uporabljali plavajoče zapore za zadrževanje Judov za prevoz v koncentracijska taborišča med drugo svetovno vojno, Rusi pa so uporabljali ladje, imenovane barže smrti, za zapiranje političnih disidentov med rusko državljansko vojno.
Uporaba zaporniške ladje je bila pogosto rešitev problema, kaj storiti z ujetimi sovražniki na nenadzorovanem ozemlju ali v času razširjene nestabilnosti. Zaporniki niso bili poslani v plavajoče bivalne prostore z garancijo za morebitno izpustitev, dobro obravnavo do sojenja ali celo z osnovnimi humanimi življenjskimi pogoji. Številni zaporniki so umrli zaradi obžalovanja vrednih razmer ali pa jih je ena ali druga stran v spopadu zaklala.
Ta vrsta zapora je skozi stoletja izginila, ko so bili vzpostavljeni mednarodni standardi za temeljne človekove pravice in ravnanje z ujetniki v času vojne. Nekatere jurisdikcije pa bodo še vedno uporabljale zaporno ladjo kot uradni objekt v svojem kazenskem sistemu. V takih okoliščinah je uporabljena ladja posebej zasnovana za humano nastanitev zapornikov in ne le za preoblikovano vojaško plovilo.
Čeprav je splošno prepričanje, da so grozote uporabe ladij za zapiranje in mučenje sovražnikov zunaj jurisdikcije, na neobračunskem prostranstvu odprtega morja in brez koristi pravnega postopka za zaščito osnovnih človekovih pravic zgodovinska anomalija, ZDA so ga skupine za človekove pravice obtožile uporabe te prakse za zadrževanje in prevoz sovražnikovih borcev v vojni proti terorizmu. Kot v vojnah v preteklosti se zdi, da je zaporna ladja najlažji način za vojsko, da ravna z ujetniki na tujem ozemlju. Ameriška vlada je zanikala uporabo ladij kot plavajočih zapor v zgodovinsko razvpitem pomenu, in dokazano je, da so bili zaporniki vsaj prepeljani z ladjo na lokacije zunaj njihove matične države.