Leta 1995, ko je Netscape prvič zasnoval in implementiral funkcionalnost piškotkov v svoj brskalnik, ni bilo na voljo nobenih kontrolnikov piškotkov. Piškotki so bili samodejno omogočeni privzeto. Skupine Watchdog so kmalu izvedele, da se piškotki uporabljajo za invazivne namene in za rešitev težave se je pojavila programska oprema tretjih oseb. Vnesite čistilo piškotkov.
Prve različice programov za čiščenje piškotkov so le izbrisale vse piškotke, ki so bili najdeni na trdem disku ob zagonu ali izmenično ob zaustavitvi. Niso preprečili, da bi se piškotki nastavili ali namestili v računalnik, niti jih ni bilo mogoče v veliki meri konfigurirati. Tovrstna funkcija za čiščenje piškotkov je bila vgrajena v številne pomožne programe kot bonus funkcija, vendar se je nekaterim zdela neprijetna, ker so bili uporabni piškotki izbrisani skupaj z neželenimi piškotki.
Kmalu je čistilo piškotkov postalo bolj upravitelj piškotkov, ki je vključeval večji nadzor nad piškotki. Verjetno najbolj priljubljen in celovit nagrajeni čistilec in upravitelj piškotkov je bil Cookie Crusher podjetja The Limit Software. Cookie Crusher ni samo očistil piškotkov, ampak je bil prvi program za piškotke, ki je uporabniku omogočil, da prepreči nastavitev piškotkov. S to generacijo čistilnika piškotkov bi lahko uporabniki ustvarili seznam spletnih mest, ki bi jim morala biti dovoljena nastavitev piškotkov, pri čemer bi ohranili želene piškotke.
Vendar se je izkazalo, da je tudi to preveč splošno, saj so spletna mesta, ki so generirala uporabne piškotke, generirala tudi piškotke za sledenje spletu, včasih od tretjih oglaševalcev. Čistilec piškotkov se je ponovno odzval na klic, pri čemer je prednjačil Cookie Crusher, ki je ponudil ekskluzivno funkcijo za izboljšanje razvrščanja piškotkov še korak naprej. Ponujal je razvrščanje ne le po naslovu spletnega mesta, temveč tudi po vrsti piškotka, ki je predstavljen na spletnem mestu. Registracijski piškotek je bilo mogoče identificirati in shraniti, medtem ko bi lahko sledilni piškotek z istega mesta samodejno zavrnil.
Danes je na voljo bogata paleta čistil in upravljavcev piškotkov. Z leti je bil nadzor piškotkov vgrajen tudi v brskalnike, vendar lahko čistilec ali upravitelj piškotkov tretjih oseb ponudi višjo stopnjo prilagodljivosti in enostavnosti pri nadzoru piškotkov sproti ali na zahtevo. Če želite več nadzora nad piškotki, kot ga omogoča vaš brskalnik, ali ločen program zaradi dodatne varnosti, bosta čistilec in upravitelj piškotkov ustrezala vašim namenom.