Zasebnost iskalnikov je skrb mnogih posameznikov in podjetij. Podjetja lahko uporabljajo rezultate iskalnikov za številne različne namene, od vedenjskega ciljanja do preproste statistike iskanja. Na zelo osnovni ravni lahko posameznik uporablja računalnik nekoga drugega in preveri, kaj je bilo iskano, ob predpostavki, da lastnik računalnika ni izbrisal shranjenih podatkov brskanja. Običajno vdori v zasebnost iskalnikov niso zlonamerni; pogosto se uporabljajo samo za zagotovitev, da so oglasi, ki jih nekdo vidi na spletu, ustrezni za njegove interese.
Posamezniki imajo lahko veliko različnih razlogov, da želijo svoje internetno iskanje ohraniti skrivnost; te ljudi ponavadi zelo zanima zasebnost iskalnikov. Včasih so razlogi preprosto osebni. To lahko vključuje vse, od pornografije do finančnih ali zdravstvenih informacij. Drugi ljudje se bojijo, da bi nekdo prek rezultatov iskalnika odkril njihove zasebne podatke, kot so ime, naslov, telefonska številka ali številka socialnega zavarovanja. Ne glede na njihove motivacije se mnogim različnim ljudem zdi pomembna zasebnost iskalnikov.
Podatki iskalnika se lahko v nekaterih primerih zlonamerno uporabijo, vendar to ni vedno res. Podatki, vneseni v večino priljubljenih iskalnikov, na splošno niso zasebni. Podjetja, ki upravljajo iskalnike, lahko dostopajo do iskalnih poizvedb in jih uporabljajo za oglaševalske in raziskovalne namene. Na splošno to ne vodi do nič drugega kot do bolj ciljnih oglasov. V nekaterih redkih primerih pa lahko napačni ljudje dobijo v roke iskalne poizvedbe in včasih vidijo zasebne podatke, ki so jih posamezniki vnesli v svoje iskalnike.
Iskalniki niso vedno povsem varni, zato je na splošno nespametno vanje vnašati zasebne podatke. Obstaja več drugih metod, ki jih ljudje uporabljajo za zagotavljanje zasebnosti iskalnikov. Ena možna možnost je uporaba javnega računalnika; če iskalne poizvedbe ni mogoče povezati s posameznikom, ni posebej pomembna. Nekatera spletna mesta ponujajo orodja, s katerimi je mogoče zagotoviti anonimnost pri iskanju posebej občutljivih informacij. Uporaba različnih iskalnikov lahko prepreči, da bi kateri koli iskalnik razvil popoln profil posameznega uporabnika.