UV dezinfekcija je metoda uporabe ultravijoličnega sevanja za uničenje mikroorganizmov, ki morda živijo v vodi, in tako postane varna za pitje. Za čiščenje vode na ta način se pogosto uporabljajo živosrebrne obločne sijalke za ustvarjanje ultravijolične svetlobe. Svetloba prodre v celične stene bakterij, parazitov, virusov in drugih živih onesnaževal ter spremeni njihovo DNK. Glede na intenzivnost sevanja in dolžine izpostavljenosti jih to bodisi ubije ali prepreči njihovo razmnoževanje. Enako tehniko je mogoče uporabiti za saniranje odpadne vode.
Pri eni metodi UV dezinfekcije so UV žarnice nameščene v kremenčevih ceveh in nameščene nad ali okoli tekoče vode. Kremen je ena redkih trdnih snovi, v katero lahko prodre ultravijolično sevanje, kar omogoča, da je okoliška voda izpostavljena čistilnim žarkom. Pomanjkljivost tega sistema je, da se snovi, raztopljene v vodi, nabirajo na izpostavljenih stenah kremenčeve cevi in preprečujejo uhajanje sevanja v vodo.
Druga metoda UV dezinfekcije uporablja banke UV žarnic, obdanih s Teflon® cevmi. Teflon® je odličen prevodnik ultravijoličnega sevanja, zato je voda, ko teče skozi te cevi, izpostavljena svetlobi z vseh strani in sanirana. Ti sistemi cevi Teflon® so pogosto obdani z aluminijastim ohišjem, ki odbija UV svetlobo, ki se ne absorbira nazaj v vodo. Za razliko od kremena, Teflon® običajno ne zbira nečistoč, ki bi lahko blokirale sevanje.
Obe metodi sta boljši od razkuževanja z vodikovim peroksidom ali klorom, ker ne uporabljata kemikalij. To pomeni, da v prečiščeni vodi ne ostane nobenih kemičnih ostankov, okolje pa ni izpostavljeno škodljivim kemikalijam. Vendar pa zaradi kemikalij, ki jih puščajo za sabo, te bolj tradicionalne metode metod dezinfekcije vode ponujajo nekaj preostalega razkuževanja, česar UV dezinfekcija ne.
UV dezinfekcija ni tako učinkovita pri motni vodi, saj se lahko bakterije in drugi onesnaževalci skrijejo v večjih delcih in preprečijo izpostavljenost sevanju. Ta vrsta dezinfekcije je odvisna tudi od pravilno delujoče opreme. Voda mora teči neprekinjeno, da se prepreči pregrevanje sistema, ki bi lahko premaknilo frekvenco sevanja izven protimikrobnega območja. Prav tako je treba svetilke redno menjati, da zagotovite, da oddajajo ustrezno količino sevanja.
Stroški UV dezinfekcije so primerljivi s stroški dezinfekcije s klorom. Ker se bo tehnologija za UV žarnice in sisteme za čiščenje izboljševala, se bodo stroški verjetno še znižali, kar bo spodbudilo več ljudi k uporabi ultravijoličnih čistilnikov vode. To pa lahko poveča konkurenco med proizvajalci in distributerji teh sistemov, ohranja nizko ceno, UV dezinfekcija pa postane ena izmed najboljših metod sanitacije vode.