Obstaja lahko veliko načinov čiščenja preproge, poškodovane z vodo. Postopek bo odvisen od nekaj različnih dejavnikov, vključno z vrsto in obsegom škode zaradi vode. Prizadevanja za obnovo se morajo začeti čim prej po puščanju vode ali poplavi, da se prepreči rast plesni. Najprej odstranite čim več odvečne vode s preproge in oblazinjenja. Nato preprogo temeljito očistite z dezinfekcijsko raztopino, vendar jo najprej preizkusite, da se prepričate, da ne bo povzročila nadaljnje poškodbe. Na koncu odstranite preprogo z lepilnih trakov in postavite ventilatorje spodaj, da se posuši. Ta metoda lahko deluje za manjša območja poškodb zaradi vode, v hujših primerih pa bo morda treba preprogo zamenjati.
Eden najpomembnejših dejavnikov pri določanju, ali je mogoče obnoviti preprogo, poškodovano z vodo, je vrsta vode. Vodni viri, kot je cev, ki pušča, veljajo za sanitarne, ker ni verjetno, da bi vsebovali bakterije ali druge škodljive onesnaževalce. Če je poplavo povzročil sanitarni vir, je preprogo, poškodovano z vodo, pogosto mogoče obnoviti. Drugi viri vode, kot so prelivi pomivalnega stroja ali stranišča, se lahko štejejo za nesanitarne, kar pomeni, da je nevarnost za zdravje prevelika in da je treba preprogo zamenjati. Preprogo, poškodovano zaradi črne vode, ki lahko izvira iz rezervne odplake ali poplave, je skoraj vedno treba zamenjati zaradi verjetnosti kontaminacije.
Pri manjših poškodbah ali poplavah, ki jih povzročijo sanitarni viri, je treba takoj odpraviti vir puščanja vode in odstraniti odvečno vodo s preproge. Nato je treba uporabiti razkužilno raztopino, kot sta belilo in voda, da preprečimo rast plesni ali drugo onesnaženje preproge. Nato lahko preprogo odstranite z lepilnih trakov in posušite z ventilatorjem pod njo. Včasih je mogoče odstraniti podstavke in izvrtati luknje v suhem zidu blizu tal za pomoč pri prezračevanju. Zagon razvlažilca zraka v prostoru lahko pomaga tudi pri hitrejšem sušenju preproge, poškodovane z vodo.
Med postopkom sušenja lahko pomaga, da se izognete hoji po mokri preprogi, da preprečite madeže in dodatno poškodujete preprogo. Voda lahko včasih povzroči, da se podloga lepila loči od vlaken preproge, kar se imenuje delaminacija. Prav tako je treba z mokre preproge čim prej odstraniti vse pohištvo, saj lahko morebitna barvila ali madeži s pohištva povzročijo madeže. Pohištvo se lahko poškoduje tudi, če vpije vodo iz preproge.