Vegetacijo mokrišč sestavljajo trave, rastline, grmičevje in drevesa, ki rastejo v zemlji, ki je večino leta nasičena, ali v sami vodi. Te rastline se imenujejo hidrofiti, kar pomeni, da imajo radi vodo. Tako vodne kot kopenske vrste se lahko prilagodijo razmeram v mokriščih ob obali in v notranjosti. Štiri skupine mokrišč so obalni, nastajajoči, plavajoči in potopljeni.
Obalne rastline rastejo ob robovih ribnikov, jezer, potokov, močvirja in barij. Lahko rastejo na gladini vode ali se ukoreninijo v plitvini. Na teh območjih uspevajo rastline, kot je vijoličasta luskavica, pogosto do te mere, da postanejo invazivne. V tovrstnem mokriškem podnebju rastejo preslica, puščica, potočna kreša in šotni mah. Na teh območjih lahko najdemo tudi velika močvirna drevesa, kot so mangrove, slana cedra in skoraj vse vrste borovcev.
Nastajajoča močvirna vegetacija je zakoreninjena v tleh, ki je večino časa pod vodo. Te rastline rastejo v vodi in segajo v zrak zgoraj. Rastline puščic pogosto rastejo v gostih skupinah v tem močvirnem podnebju. Druge vzhajajoče rastline so vodna vrba, rogoz in mrzlica. Večina rastlin v tej kategoriji običajno uspeva tam, kjer je voda globina manj kot 5 čevljev (1.5 m).
V vodi rastejo plavajoče rastline s koreninami, ki segajo precej globoko skozi vodo do dna. Le majhen del teh rastlin, običajno cvetovi, raste nad vodno gladino. V to kategorijo spadajo vodne lilije, lokvanji in vodne hijacinte.
Potopljene rastline popolnoma uspevajo pod vodo, čeprav se lahko kakšen list ali dva prebijeta skozi površino vode. Večina teh rastlin celo cveti pod vodo. Vodna kreša in vodni list sta dve vrsti mokrišča, ki obstajata pod vodo. Te zasaditve mokrišč lahko dejansko tvorijo območja, podobna travnikom na vodnem dnu.
Vse te mokriščne rastline rastejo v vlažnih mokriščih. To vrsto tal ustvarijo pogoji, nasičeni z vodo, z zelo malo kisika ali pa ga sploh ni. Lahko ima zgornjo plast gnile rastlinske snovi, ki se zelo počasi razgrajuje.
Skoraj vse te rastline so dragocen vir hrane za divje živali na mokriščih. Živali, kot so vodne ptice, želve, pižmovke in ribe, se hranijo z rastlinami in njihovimi semeni. Močvirna vegetacija ustvarja habitate za te živali, pa tudi za druge ptice, polže in žuželke. Zagotavljajo varna gnezdišča in gnezdišča za ta in mnoga druga bitja.
Močvirna vegetacija služi številnim uporabnim namenom. Ne samo, da vpija vodo, ki bi sicer povzročila poplave, ampak tudi upočasni pretok. Prav tako pomaga preprečevati obalno erozijo in tudi filtrira onesnaževala in usedline.