Gen za odpornost na kanamicin (nptII ali nptIII) je niz DNK, ki omogoča organizmu, da proizvede beljakovino, ki daje odpornost na običajni antibiotik kanamicin. Ta gen se pogosto uporablja kot selektivni marker za eksogene plazmide – plazmide, ki niso naravno prisotni – v organizmih, kot so bakterije ali kvasovke. To selekcijsko sredstvo se uporablja tudi v rastlinah. Znanstveniki, ki preučujejo genetiko ali proteomiko, lahko na podlagi uporabe kanamicina izberejo bakterijske kolonije, ki vključujejo vstavljen gen, ki ga zanima. Kanamicin bo ubil vsako celično kolonijo, ki ne vključuje celic, ki prepisujejo in prevajajo povezani gen za odpornost.
Gen za odpornost na kanamicin ima naravni izvor in ga najdemo v Streptomyces kanamyceticus, bakteriji, ki je sposobna proizvesti encim, ki razgradi kanamicinski antibiotik, preden lahko antibiotik uniči bakterijo. Vsaka celica, ki lahko prebere ta gen in prepiše nastali encim, bo imela odpornost na kanamicin. Ta gen je bil izoliran iz odpornega bakterijskega seva in kopiran v druge plazmide. Z uporabo encimov lahko znanstveniki oblikujejo plazmide, ki vključujejo odpornost proti selekcijskim sredstvom, kot je kanamicin.
Odpornost na aminoglikozide, kot je kanamicin, učinkuje na številne poti. Genetska odpornost na kanamicin je lahko posledica zmanjšane prepustnosti celic ali celične inaktivacije encima kanamicina. Možno je tudi, da celica pokaže odpornost na kanamicin s kromosomsko spremembo, ki vodi do spremembe ribosomov te celice. Ta zadnja odpornost pa za genetike ni tako uporabna kot druge poti, ker temelji na kromosomski DNK in ne na oblikovanih plazmidih. Z drugimi besedami, ta upor je naraven in ga ni mogoče vstaviti.
Gen za odpornost na kanamicin ima določeno odpornost na druge antibiotike in selekcijska sredstva, kot sta gentamicin in neomicin. Zaradi te lastnosti je gen za odpornost na kanamicin manj uporaben, ker široka selekcijska sredstva preprečujejo specifično selekcijo bakterijskih sevov. Z drugimi besedami, če bi znanstvenik želel preučiti interakcijo dveh plazmidov in ju vstaviti v enocelični organizem, kot je kvas, znanstvenik ne bi mogel uporabiti odpornosti na neomicin ali gentamicin kot izbirni marker, če se že zanaša na odpornost na kanamicin. na.
Odpornost na kanamicin se običajno uporablja v laboratorijih in je postal običajno selekcijsko sredstvo za uporabo v gensko spremenjenih organizmih. Kot eden najpogostejših antibiotikov naj bi kanamicin obstajal v izobilju. Posledično je malo omejitev glede uporabe kanamicina v rastlinskih transgenih in genskih modifikacijah rastlin za obsežno industrijsko kmetijsko proizvodnjo.