Kaj je Microarray?

Mikromreža je zaporedje pik DNK, beljakovin ali tkiva, razporejenih na niz za enostavno hkratno analizo. Najbolj znan je mikromrež DNK, ki igra pomembno vlogo pri profiliranju genske ekspresije. Material podlage je steklo, plastika ali silikonski čip. Alternativna imena za mikromrež DNK vključujejo genski čip, DNK čip in biočip. Majhni deli DNK se imenujejo sonde.

Mikromrež je mogoče izdelati na različne načine. Najbolj primitivno je preprosto spustiti DNK na steklena stekelca z zatiči. Bolj sofisticirane tehnike uporabljajo fotolitografijo, elektrokemične pristope in celo brizgalno tiskanje – vse, kar lahko natančno dostavi DNK na točno določeno mesto.

DNK mikromreža je produkt poznih osemdesetih in zgodnjih devetdesetih let prejšnjega stoletja, ko se je biotehnologija zares začela razvijati. Mikromrežje omogoča raziskovalcu, da izvede zaporedje testov na vseh vzorcih hkrati, kar močno pospeši raziskavo. Tradicionalni biološki eksperimenti delujejo na stvareh eno za drugo. Sonde so včasih označene s pikami, imenovanimi fluorofore, kadar jih ni mogoče zlahka ločiti.

Nekateri največji mikromrež, ki jih izdelujejo podjetja, kot je NimbleGen Systems, vsebujejo kar 390,000 točk. Mikromrež se pogosto uporablja pri analizi celotnega genoma organizma, ki lahko vsebuje na desetine kromosomov ali več, vsak s svojo DNK in RNK. Na žalost niso vsi mikromrežji med seboj združljivi in ​​očitno je pomanjkanje standardov. Prizadevanja za standardizacijo potekajo, a zaenkrat še neuspešno.

Tako kot večina najsodobnejših biotehnoloških raziskovalnih programov lahko tudi testi na mikromrežih proizvedejo ogromne količine podatkov, kar povzroči področje bioinformatike, ki skuša vse skupaj osmisliti. Morda obstajajo odkritja in korelacije, ki smo jih že izmerili, a jih zaradi prelivanja podatkov preprosto nismo opazili. Podatkovno rudarjenje se v veliki meri uporablja za analizo rezultatov teh zapletenih eksperimentov.