Prostorsko ekologijo lahko najbolje opišemo kot preučevanje razmerja med pokrajino ter organizmi in življenjskimi oblikami v tem prostoru. Ekologi že leta preučujejo gibanje rastlinskih in živalskih populacij glede na okolico, saj je gibanje tako rastlin kot živali znotraj pokrajine mogoče opisati z nekaterimi prostorskimi legami kopenskih struktur. Prostorsko ekologijo je morda najlažje opisati glede na rastlinske populacije, saj jih najlažje preučujemo in nanje najbolj neposredno vpliva krajinska struktura.
Struktura pokrajine lahko drastično vpliva na način, kako rastlinske populacije rastejo in se premikajo po svojem okolju. Konstrukcije, kot so gozdne ceste in poti, bi lahko zaradi spremembe razpoložljivih virov ali razpršilnega mehanizma pripomogle k nastanku nekaterih invazivnih vrst še dolgo po izgradnji ceste ali poti. Gozdne ceste zagotavljajo odprto površino, višjo koncentracijo svetlobe in povečano vlažnost tal, hkrati pa zagotavljajo poti za usmerjeno razpršitev semena preko živali ali vode. Ne glede na to, ali omrežja cest in poti povzročajo tujerodne invazije, bo razumevanje in povezovanje učinkov, ki jih lahko imajo linearne habitatne strukture, kot so ceste in poti, na invazije rastlin približalo raziskovalcem možnost nadzora nad prihodnjimi invazijami naravnih habitatov.
V gozdnem matriksu obstaja več dejavnikov, ki lahko vplivajo na rast rastlin, vendar bi lahko struktura naravne krajine najbolj vplivala na potencialno invazijo tujerodnih vrst. Linearne značilnosti v gozdovih, kot so ceste in poti, zagotavljajo večjo razpoložljivost svetlobe in motnje ter lahko zagotovijo habitat za rastlinske vrste, ki jih širijo živali. Naključno opazovanje kaže, da se lahko nekatere rastlinske populacije širijo vzdolž habitatnih koridorjev v “valu” ustanavljanja in da lahko ti koridorji zagotavljajo povezavo od napadenih območij do nenapadenih pokrajin.
Pri številnih rastlinskih vrstah so opazili prednostno naselitev vzdolž poti in obcest zaradi razširjanja semena z živalskimi prenašalci. Linearni habitat pa je lahko edini primeren habitat za vrsto. Izkazalo se je, da gozdne ceste, žive meje in bregovi potokov pomagajo pri širjenju avtohtonih rastlinskih populacij prek neprimernega habitata. Te linearne značilnosti lahko pomagajo tudi pri invaziji tujerodnih rastlin. Ko se invazivna vrsta lahko uveljavi ob poti ali cesti, ki seka nenapadeni gozd, ima lahko ta vrsta možnost vdreti v gozdno podlago, senčeno območje pod krošnjami dreves.
Preučevanje prostorske ekologije lahko pripelje do številnih odkritij tudi glede živali. Živali reagirajo na enak način kot rastline, sledijo koridorjem gibanja in se počasi premikajo z enega habitata na drugega, tako imenovani otoški učinek. Brez tehnik prostorske ekologije, kot je statistična analiza prostorske pokritosti, razumevanje, kako se rastline in živali premikajo skozi okolje, ne bi bilo mogoče.