Katere so različne vrste kompletov za izolacijo RNA?

Večina kompletov za izolacijo ribonukleinske kisline (RNA) lahko izolira visokokakovostno RNA iz širokega spektra tkiv in vrst organizmov, vključno z rastlinami, živalmi in virusi. Mitohondrijska in ribosomska RNA – mRNA oziroma rRNA – lahko zahtevajo specializirane komplete za izolacijo RNA, specifične za majhne verige RNA. Drugi dejavniki, ki se lahko razlikujejo med različnimi kompleti za izolacijo, so količina vzorcev, ki jih lahko obdela vsak komplet, in čas, potreben za popolno obdelavo vzorca.

Najpogostejše vrste kompletov za izolacijo RNA se lahko uporabljajo za veliko različnih aplikacij, ne glede na to, od kod prihaja RNA. Celice in tkiva sesalcev so med najbolj prevladujočimi viri, ki se uporabljajo za izolacijo in čiščenje RNA. Rastlinske celice in virusi se uporabljajo tudi v poskusih molekularne biologije, ki zahtevajo uporabo kompleta za izolacijo RNA.

Ko je vzorec tkiva ali krvi zbran, ga je treba pripraviti za izolacijo RNA med kritičnim procesom, znanim kot celična degradacija, ločitev ali motnja. Če se celični material ne poruši, bo proces izolacije RNA proizvedel manj RNA. Najboljši kompleti za izolacijo RNA vključujejo materiale in zaloge za razgradnjo celic pred izolacijo in čiščenje RNA po izolaciji.

V posebnih primerih, ko poskus zahteva mRNA ali rRNA, so na voljo specializirani kompleti za izolacijo RNA za verige RNA, ki so še posebej majhne. Materiali in materiali, vključeni v takšen komplet, se lahko razlikujejo glede na količino in velikost. Ti kompleti za izolacijo RNA so manj pogosti kot večnamenski kompleti RNA in lahko pride do znatne razlike v stroških.

Številni običajni kompleti za izolacijo RNA so zasnovani za uporabo z vsemi vrstami tkiv in celic in lahko zaključijo reakcijo v približno 20 minutah. Čas, potreben za popolno celično razgradnjo, se lahko razlikuje glede na to, kje v organizmu so bile celice zbrane. Poleg stopnje celične razgradnje sta postopek izolacije RNA in naknadno čiščenje relativno standardna v smislu postopka in časa.

Druga značilnost, ki je lahko specifična za določene komplete, je količina vzorca, ki je potrebna za obdelavo reakcije. Medtem ko lahko nekateri izolacijski kompleti zahtevajo relativno veliko količino vzorca, lahko drugi kompleti dobro delujejo z manjšo prostornino. Ta razlika je lahko prednost, če je količina vzorca omejevalni dejavnik.
Številni proizvajalci kompletov za izolacijo RNA imajo na internetu na voljo primerjalne karte. Te tabele je mogoče uporabiti za prikaz razlik med različnimi kompleti, ki jih proizvajajo. Razlike lahko vključujejo posebne vrste aplikacij, kemikalije in zahtevane količine vzorcev.