Endokrini sistem in homeostaza sta povezana predvsem s tem, da je mogoče nekatere vzroke neravnovesja odpraviti z endokrinim posegom. Homeostazo si lahko predstavljamo kot uravnoteženo stanje sistema. To se lahko nanaša na kateri koli sistem ali velja za živo bitje, kot v primeru fiziologije. Stanje dinamičnega ravnovesja, podoben izraz, se od homeostaze razlikuje po tem, da se nanaša na ravnotežje, povišano nad izhodiščem, medtem ko je homoestaza ravnovesje na izhodišču. Ko je homeostaza zaradi notranjih ali zunanjih ukrepov vržena iz ravnovesja, mora telo delovati, da obnovi to stanje. Če je krivec za neravnovesje hormonske narave, potem sta endokrini sistem in homeostaza tesno povezana.
Skoraj vsak fiziološki ukrep zdravega telesa je dejanje za vzdrževanje homeostaze. Obstaja nenehna in neskončna količina stresorjev, ki poskušajo telo vreči iz ravnovesja. Hoja po stopnicah zahteva energijo, zaradi česar srčno-žilni in mišični sistem telesa težje delujeta, kar zahteva povišano stanje. Telo se mora nato temu zoperstaviti tako, da poišče načine, kako se vrniti na izhodišče.
Endokrini sistem je skupek žlez ali struktur, ki sproščajo hormone, ki delujejo tako, da te regulatorne kemikalije neposredno vbrizgajo v krvni obtok. Ne gre ga zamenjati s podobnim eksokrinim sistemom, ki uporablja kanale za induciranje hormonskih sprememb in ni neposredna pot v krvni obtok. Ko so v obtoku, ti hormoni potujejo v različne organe telesa in če so prisotni njihovi posebni ciljni receptorji, povzročijo verigo dogodkov, ki se zaključijo z želenim fiziološkim učinkom.
Če na primer srce bije prehitro brez kakršne koli fiziološke potrebe, bi bila endokrini sistem in homeostaza povezana s tem, da lahko hormon upočasni srce. Ta hormon lahko določena žleza sprošča neposredno v krvni obtok in kroži v številne organe. Vsak hormon pa ima poseben receptor in če ta receptor ni prisoten, ne bo vplivalo. Zato bo sproščanje hormona vplivalo samo na organe, ki so tarča hormonskega posega.
Če povzamemo, endokrini sistem in homeostaza sta povezana tako, da skupaj omogočata vsakodnevno delovanje. Brez hormonskega posega človeško telo v mnogih primerih ne bi moglo spremeniti svojega metabolizma na način, ki je potreben za ravnovesje. Zaradi tega je endokrini sistem zelo pomemben del fiziološke regulacije.