Mikrobne podloge so večplastne plošče mikroorganizmov – večinoma bakterij in arhej (druga domena mikrobov velikosti bakterij), ki so prevladovale večino planeta milijarde let, pred razvojem večceličnih organizmov, ki so te mikrobe takoj pojedli. so prispeli na prizorišče. Mikrobne preproge se pogosto nahajajo na vmesniku med dvema snovema, zlasti v vlažnih ali potopljenih okoljih, kot je morsko dno. Te mikrobne podloge držijo skupaj zunajcelične polimerne snovi – znane tudi kot pena -, ki krepijo njihovo strukturo in jih oprimejo substrata.
Fosilni dokazi o mikrobnih preprogah se pojavljajo že pred 3,500 milijoni let in služijo kot najzgodnejši neposredni dokaz življenja na Zemlji. Sprva so bili mikrobi v preprogah kemoavtotrofni, kar pomeni, da so dobili energijo in ogljik z združevanjem kemikalij, ki jih najdemo večinoma v hidrotermalnih odprtinah na dnu oceana. Potem, pred približno 2,600 milijoni let, so mikrobi razvili fotosintezo, iz “hidrotermalnega geta” so se lahko razširili v veliko širši razpon okolij, zlasti v zgornjih 100 – 300 m (328 – 985 ft) vodnega stolpca, znanega kot pelagično območje in kateri koli del morskega dna z razpoložljivo svetlobo.
Mikrobne preproge so kontekst prvih razvitih večceličnih organizmov. Nekateri znanstveniki trdijo, da so najzgodnejši večcelični organizmi, ediakarska favna, živeli pritrjeni na blazine in pridobivali energijo s simbiozo z algami, razporejenimi po njihovih telesih. Vsaj to se zdi verjetno, saj organizmom Ediacaran primanjkuje črevesja ali kakršnega koli očitnega prehranjevalnega aparata. V tako imenovanem “življenje na blazinah” so se mobilni organizmi sprva razvili kot rovovci v blazinah, ki so skozi njih kopali plitve vodoravne jame, od katerih so nekatere ohranjene še danes.
V kambrijskem obdobju, pred približno 542 milijoni let, je prišlo do “revolucije bioerozije”, ki se je zgodila, ko so mobilne živali razširile svojo velikost, kompleksnost in nabor vedenj. Pravzaprav so zapleteni navpični rovovi – odsotni v prejšnjem edikarskem obdobju – del uradne definicije začetka kambrija, skupaj s pojavom vseprisotnih organizmov, znanih kot favne majhnih školjk. Te zapletene jame so zaznamovale začetek konca mikrobnih preprog, ki si niso več mogle privoščiti obstoja kot tako koncentriran vir hrane na prostem. Danes mikrobne preproge najdemo le na območjih brez večine drugega življenja, kot so tanke skorje v puščavah, v zelo slani vodi ali v globokih delih oceanskega dna.