Candida je gliva ali kvasovka, ki lahko raste v črevesni flori črevesja zaradi prekomerne uporabe antibiotikov in drugih okoljskih dejavnikov. V nekaterih krogih naravnega in alternativnega zdravljenja je kefir za zdravljenje kandide zelo priljubljen za spodbujanje zdrave črevesne flore in za zmanjšanje morebitne prekomerne rasti kvasovk. Menijo, da probiotiki v kefirju pomagajo stabilizirati zdrave bakterije v telesu in ubijajo vse škodljive bakterije, ki bi lahko sprožile okužbo. Nekatere študije so pokazale, da je določena vrsta probiotičnih bakterij v pomoč pri zmanjševanju prekomerne rasti kvasovk; vendar so posebne študije o učinkih kefirja na kandido minimalne in ne kažejo na zanašanje na edino zdravljenje te motnje.
Ker je kandida kategorizirana kot kvasovka ali bakterijska okužba, ki večinoma naseljuje črevesno floro v črevesju, se številne naravne terapije osredotočajo na obnavljanje črevesne flore s probiotiki. Probiotiki se na splošno imenujejo dobre bakterije v črevesju, ki pomagajo krepiti imunski sistem in se boriti proti tujim vsiljivcem. Kefir, fermentirana pijača, ki je podobno kot pitni jogurt, vsebuje veliko naravnih probiotikov, ki lahko spodbujajo te funkcije v telesu. Menijo, da lahko probiotiki, prisotni v pijači, pomagajo pri boju proti slabim bakterijam, povezanim s kandido in prekomerno rastjo kvasovk.
Razen slabe prehrane in splošnega nezdravega načina življenja je prekomerna uporaba antibiotikov pogosto splošen mehanizem, zaradi katerega lahko pride do prekomerne rasti kvasovk. Uporaba probiotikov za boj proti učinku antibiotikov je lahko koristna, saj bodo probiotiki pomagali napolniti črevesno floro z novimi zdravimi bakterijami, ki so potrebne za pravilno podporo imunskega sistema. Kefir za kandido je prav zaradi tega priljubljen, saj večina kefirjevih pijač vsebuje dober vir potrebnih probiotikov. Jasno pa je, da uporabe kefirja za zdravljenje kandide ne smemo uporabljati kot edino zdravljenje, saj so lahko druge dokazane konvencionalne terapije še bolj koristne.
En probiotični sev, imenovan saccharomyces boulardii, je pokazal določeno učinkovitost pri zmanjševanju ravni kandide v telesu. To lahko pokaže, da je uporaba kefirja za kandido lahko koristna, saj zagotavlja to določeno vrsto dobrih bakterij. Še vedno je potrebnih več raziskav, da bi ugotovili, ali je količina tega seva bakterij v večjih pijačah iz kefirja dovolj pomembna za boj proti prekomerni rasti kvasovk. Nesladkani kefir naj bi bil najboljši vir tega probiotika, če ga uporabljate za kandido, saj lahko sladkor hrani kvas in poslabša težavo.