Naravni estrogenski nadomestni hormoni so alternativno hormonsko nadomestno zdravljenje za ženske v menopavzi. Med menopavzo telo proizvaja veliko manjšo količino estrogena in progesterona, ženska pa nima več menstrualnega ciklusa, ker so njeni jajčniki prenehali mesečno sproščati jajčeca. Naravna estrogenska nadomestna terapija je sestavljena iz uživanja izdelkov in živil, ki spodbujajo ali imajo visoko raven fitoestrogena. Na voljo je kemična estrogenska nadomestna terapija, vendar so bile študije, ki so pokazale, da te kemikalije močno povečajo možnost za razvoj raka dojke pri ženskah, zato mnoge ženske iščejo naravne alternative kemičnemu hormonskemu nadomestnemu zdravljenju.
Izdelki iz soje so izjemno bogati z izoflavoni, skupino živil, ki vsebujejo fitoestrogen. Tofu, edamame, sojino mleko in dodatki so najbolj priljubljeni viri hrane, ki vsebujejo velike količine sojinih zrn. Uživanje sojinega zrna pri ženskah v menopavzi je bilo predmet številnih študij in ugotovljeno je bilo, da zmanjšuje stranske učinke menopavze, hkrati pa povečuje mineralno gostoto kosti žensk.
Linagani vsebujejo tudi veliko estrogenom podobnih kemikalij. Lanena semena, sezamova semena, večzrnati kruh in sončnična semena vsebujejo veliko količino linagana. Mnogi od teh virov hrane so tudi antioksidanti in ob zaužitju proizvajajo omega-3 maščobne kisline, kar lahko pomaga preprečiti razvoj drugih zdravstvenih stanj. Laneno seme in olje iz lanenega semena lahko pomagata zmanjšati simptome menopavze, vključno z oblivi vročine ali nočnim znojenjem.
Dong quai je zeliščni dodatek, ki vsebuje veliko količino fitoestrogena. Znan tudi kot angelica sinensis ali dang gui, dong quai uravnava proizvodnjo estrogena in drugih hormonov v telesu pri ženskah katere koli starosti, in med menopavzo, ko je raven estrogena pri ženskah nizka, bo to zelišče spodbudilo proizvodnjo estrogena v telesu. Dong quai ima številne druge zdravstvene koristi in se včasih uporablja za zdravljenje hipertenzije. Ta zeliščni dodatek je na voljo v obliki kapsul, na voljo pa so tudi čaji, ki vsebujejo dong quai.
Rdeča detelja je še ena vrsta naravnega nadomestnega zelišča za estrogen, bogata z izoflavoni in linagani ter proizvaja kemikalije, ki vplivajo na estrogenske receptorje v ženskem telesu. To zelišče proizvaja kemikalije, ki delujejo kot estrogen in zmanjšujejo pojav vročinskih utripov in nočnega znojenja pri ženskah med menopavzo. Dodatki rdeče detelje so na voljo v kapsulah, tinkturah in tudi v prahu. Ženske se morajo posvetovati z zdravnikom, ko razmišljajo o jemanju naravnih nadomestnih dodatkov estrogena med menopavzo.