Pars compacta tvori polovico substantia nigra, predela srednjih možganov v bližini možganskega debla. Primarna funkcija pars compacta je proizvodnja nevrotransmiterja, imenovanega dopamin. Dopamin se nanaša na odvisnost, čustvene odzive in gibanje. Pomanjkanje dopamina lahko povzroči Parkinsonovo bolezen, presežek pa lahko prispeva k pojavu shizofrenije.
Substantia nigra je sestavljena iz zgornjega ali zgornjega pars compacta in spodnjega ali spodnjega pars reticulata. Dendriti segajo od znotraj compacta, ki se ukvarja s proizvodnjo, v reticulato, ki se osredotoča na prenos. Pars compacta je tesno poln celic, obarvanih v črno iz pigmenta nevromelanina.
Te pigmentirane celice proizvajajo nevrotransmiter dopamin. Dopamin pomaga pri prenosu signalov med nevroni, spodbuja proizvodnjo drugih nevrotransmiterjev in pomaga nadzorovati gibanje in občutke nagrade, užitka in bolečine. Dopamin v pars compacta se preko aksoplazmatskega transporta prenese v druge predele možganov, zlasti v kavdat in putamen v striatumu.
Celice, ki vsebujejo melanin, se lahko degenerirajo, kar povzroči, da ravni dopamina padejo do točke, ko ne morejo več pomagati pri uravnavanju drugih nevronov. Ni znano, kaj povzroča to degeneracijo, vendar ustvarjeni primanjkljaj lahko povzroči nastanek Parkinsonove bolezni. Parkinsonova bolezen je neozdravljivo, izčrpavajoče stanje, ki povzroča tresenje, togost mišic in postopno prenehanje drugih gibalnih funkcij.
Možnosti zdravljenja Parkinsonove bolezni vključujejo uporabo farmacevtske mešanice levodope-karbidope. Levodopa je v razredu zdravil, imenovanih sredstva za centralno živčevje, in lahko prehaja skozi krvno-možgansko pregrado in spodbuja proizvodnjo dopamina v pars compacta. Antagonisti dopamina so razred zdravil, ki lahko posnemajo delovanje dopamina na receptorske regije, kar omogoča nadaljevanje njihovega delovanja. Nobena skupina zdravil ne more pozdraviti bolezni. Najboljše, kar lahko zagotovi zdravljenje Parkinsonove bolezni, je upočasnitev prihajajočih simptomov.
Menijo, da lahko presežek dopamina povzroči shizofrenijo. Ta predlog je naletel na nekaj polemik na medicinskem področju zaradi nezadostnih raziskovalnih podatkov. Bolniki s shizofrenijo pa kažejo fiziološke razlike v črni substanci, kar kaže na povezavo med izgubo dopamina in boleznijo. Spremembe vključujejo območje pars compta, ki prikazuje zmanjšanje velikosti prenosnih terminalov. Antipsihotiki prve generacije, ki se uporabljajo za zdravljenje simptomov shizofrenije, so spadali v razred antagonistov dopamina.