Terapevtsko kloniranje vključuje razmnoževanje celic in telesnih tkiv za medicinsko uporabo. Posledice kloniranja za tako raznolika stanja, kot so odpovedi organov in okvarjeno delovanje tkiva, so obetavne, kot tudi vrednost za splošne znanstvene raziskave. Številne ugledne znanstvene in medicinske organizacije tako podpirajo kloniranje celic, vendar številni kritiki – znanstveni in drugi – to prakso obsojajo. Trdijo, da dejansko stanje terapevtskega kloniranja ne izpolnjuje obljub in se v nekaterih primerih lahko izkaže za nevarno. Še pomembneje je, pravijo nasprotniki, da terapevtsko kloniranje sproža nekaj resnih etičnih vprašanj o življenju in smrti.
Zarodki lahko proizvedejo edinstvene matične celice, ki jih je mogoče hraniti v kateri koli vrsti organske celice ali tkiva. Če ima bolnik poškodovano srce, bi lahko klonirane celice uporabili za ustvarjanje zdravih utripajočih celic srčnega tkiva. Osebo, ki trpi zaradi hudih opeklin, je mogoče zdraviti s kloniranimi kožnimi celicami namesto z bolečimi in nepredvidljivimi postopki presaditve kože. Če je posameznik prizadet zaradi poškodbe hrbtenjače, lahko klonirane živčne celice nekega dne omogočijo, da ta oseba spet hodi. Zgoraj omenjeno je le nekaj možnih prednosti, ki bi jih lahko zagotovilo kloniranje.
Še bolj upanje je, da je možnost zavrnitve pri presaditvah organov močno zmanjšana, ker bi na novo klonirani organi izhajali iz lastnih celic prizadetega posameznika. Napredek pri kloniranju ljudi se vsako leto množi, vendar so znanstveniki že dosegli nekaj uspeha pri kloniranju prašičjih ali drugih živalskih tkiv v medicinske namene. Ker imajo prašiči podoben organski sistem kot ljudje, so sesalci idealni kandidati za osnovne raziskave in celo za presaditev organov.
Zagovorniki omenjajo uporabo kloniranja v bolnišničnih okoljih, vendar je potencial za splošne medicinske raziskave še bolj vabljiv. Razvoj celic je ključna povezava pri razumevanju kompleksnih stanj, kot so prirojene okvare in rak. Če bodo klonirane celice omogočile znanstvenikom boljše razumevanje normalnega razvoja celic, bodo s tem pridobili tudi vpogled v vzroke nenormalnega razvoja celic za številnimi okvarami in rakom. Poleg tega bi klonirane celice lahko omogočile manipulacijo – in morebitno odpravo – genetskih bolezni.
Dokazi nekaterih vodilnih znanstvenikov na tem področju pa kažejo na nekatere resne pomanjkljivosti terapevtskega kloniranja. Pravzaprav številne vaje medicinskega kloniranja niso uspešne. Veliko število kloniranih celic vsebuje okvare, kar na koncu izniči njihov namen zdravilnih učinkovin. Celo številni popolnoma klonirani organizmi doživijo pomembne okvare in prezgodaj umrejo. Uporaba celic iz kloniranih organizmov lahko ustvari lažno upanje in morda napačno zdravljenje.
Medtem ko zdravstveni pomisleki veljajo, verjetno najvidnejši glas nestrinjanja glede kloniranja katere koli vrste izhaja iz posameznikov, ki se ukvarjajo s kloniranjem zarodkov. Tako kot so podporniki in nasprotniki splava razdeljeni glede vprašanja, kdaj se življenje začne, isto vprašanje spodbuja strastno razpravo o kloniranju. Kritiki trdijo, da kloniranih zarodkov ne bi smeli uporabljati za medicinske poskuse, ker so živa bitja z lastnimi pravicami. Zarodek ima DNK in popoln genom; ima vse zmožnosti, da zraste v zrel človeški plod.
Morebitne težave, ki jih povzročata terapevtsko kloniranje in kloniranje kot celota, je mogoče nadaljevati. Verski posamezniki lahko čutijo, da kloniranje posega v stvari ustvarjanja, ki jih je najbolje prepustiti duhovnim bitjem ali naravi. Če pride do popolnega kloniranja ljudi, se lahko organizmom, ki nastanejo, odvzame individualnost in se uporabijo kot sistemi za odvzem organov za njihove darovarje. Zaradi takšnih skrbi so številne regije prepovedale prakse kloniranja.