Carski rez je lahko rešilna možnost, ko se pojavijo težave z nosečnostjo ali porodom, vendar ta vrsta operacije predstavlja določeno tveganje za otroka. Najpogostejše težave, ki lahko prizadenejo dojenčke s carskim rezom, so nizke ocene za Apgarjeve teste, ki merijo zdravje novorojenčka; težko dihanje; in prezgodnji porod. Med carskim rezom zdravnik naredi rez v materinem trebuhu in maternici, da rodi otroka. Čeprav je redka, obstaja tudi možnost, da se otrok med operacijo po nesreči poškoduje.
Apgarjevi testi se običajno dajejo novorojenčku dvakrat. Prvi test se opravi približno eno minuto po rojstvu, drugi test pa pet minut kasneje. Ta test uporablja pet meril za oceno novorojenčka: dihanje, srčni utrip, barva kože, aktivnost in odzivnost. Dojenčki s carskim rezom imajo na splošno nižje ocene po Apgarju kot dojenčki, rojeni vaginalno.
Anestezija, ki se daje materi za carski rez, lahko prečka placentno pregrado in povzroči, da bo otrok ob porodu omamljen. To bo povzročilo nižjo oceno po Apgarju. Poleg tega imajo lahko dojenčki s carskim rezom, ki so letargični zaradi anestezije, težave z budnostjo, da začnejo dojiti. To lahko upočasni proizvodnjo mleka in odloži izkušnjo vezi med materjo in otrokom.
Vaginalni porod stimulira otroka, medtem ko dojenčki s carskim rezom te vrste stimulacije ne prejmejo. To pomanjkanje stimulacije lahko prispeva k nižjim ocenam Apgar pri dojenčkih s carskim rezom. Lahko povzroči tudi težave z dihanjem.
Med vaginalnim porodom se otrokovo telo stisne. Ta kompresija je koristna za otroka, saj pomaga pri izločanju tekočine iz pljuč. Dojenčki s carskim rezom imajo popolnoma drugačno porodno izkušnjo in tega stiskanja niso deležni. To pa ne pomeni, da bodo imeli vsi dojenčki s carskim rezom težave z dihanjem. Težave z dihanjem se običajno pojavijo pri dojenčkih s carskim rezom, rojenih šele pred 39. tednom nosečnosti.
Druga težava, ki jo lahko doživijo dojenčki s carskim rezom, je prezgodnji porod. Datum poroda pri nosečnici je ocena in ga ni mogoče natančno določiti. Prezgodaj rojeni dojenčki imajo večjo stopnjo astme in drugih težav z dihanjem kot dojenčki, rojeni vaginalno.
Nekatere ženske se zaradi nečimrnosti odločijo za elektivni carski rez, saj se bojijo, da se bodo njihove nožnice iztegnile, če bodo imele normalen, vaginalni porod. Dojenčke s carskim rezom lahko med carskim rezom režete s skalpelom. Ko sta nosečnica in plod zdrava, je vaginalni porod vedno boljši od carskega reza in lahko otroku omogoči bolj zdrav začetek življenja.