Zdi se, da ura vlada življenjem ljudi in narekuje njihove dnevne ritme. Vstajajo ob določenem času, jedo v rednih časovnih presledkih in imajo lahko vsak večer določen čas za spanje. Celo naša telesa delujejo različno v različnih obdobjih dneva, pri čemer se na primer raven nekaterih hormonov med spanjem poveča, krvni tlak pa niha glede na čas dneva. Kronoterapija deluje po načelu, da življenje po uri ni le za vsakodnevne dejavnosti, ampak ima lahko koristi tudi pri nekaterih zdravstvenih težavah, kot sta astma in rak. Nekatera zdravila je mogoče časovno določiti za večjo učinkovitost, na nekatere težave z duševnim zdravjem pa prav tako močno vpliva čas. Nekaterim ljudem, ki trpijo za bipolarno motnjo, je na primer pomagala vrsta kronoterapije, ki ponastavi naravne ritme njihovih teles ali njihove telesne ure.
Za kronoterapijo so številna dokazana načela, vključno z lastnim telesnim cirkadianim ritmom. Temperatura osebe predvidljivo niha čez dan, ženska pa se dvigne, ko ovulira. Strokovnjaki, ki preučujejo športne zmogljivosti, so ugotovili, da je mišična moč večja popoldan kot zjutraj. Tudi spojine, ki jih najdemo v človeškem materinem mleku, so različne ob različnih urah dneva. Na moške vpliva hormon testosteron, ki ga zjutraj najdemo v telesu v višjih ravneh, čez dan pa se raven zniža.
Kronoterapija je dejanje usklajevanja naravnih telesnih ritmov z zdravljenjem, ki ga bolnik potrebuje, ne glede na to, ali se nanaša na psihiatrična stanja, visok krvni tlak, endokrini sistem ali druge zdravstvene težave. Kronoterapija lahko vpliva tudi na količino zdravil, ki jih bolnik prejme. Včasih je potreben manjši odmerek nekaterih vrst zdravil, če je telesna ura optimizirana. Nekaterim zdravnikom je všeč prednost, ki jo predstavlja kronoterapija, ker so videli, da se bolniki bolje držijo urnika zdravil, ko zdravila delujejo bolje, včasih pa je tudi dodatna prednost manj neprijetnih stranskih učinkov.
Vloga kronoterapije je najbolj izrazita na področju zdravljenja z zdravili, pri čemer zdravniki predpisujejo zdravila ne le glede na bolezen ali stanje, temveč tudi glede na čas dneva. Nekatere formulacije zdravil so se spremenile tako, da so boljši čas sproščanja njihovih učinkovin, in se imenujejo kronoterapevtiki. Nekatera zdravila, ki se uporabljajo za boj proti raku s kemoterapijo, so učinkovitejša ob določenih urah dneva in njihova toksičnost je zmanjšana.