Fosfatne soli se uporabljajo v številnih medicinskih zdravljenjih. Najpogostejša uporaba je za odpravo pomanjkanja fosfata pri bolniku, čeprav lahko soli pomagajo tudi odpraviti presežek kalcija. Manj pogosto se lahko soli uporabljajo za pripravo bolnika na operacijo, za lajšanje simptomov zgage in za nadzor preobčutljivosti zob in dlesni.
Pri večini ljudi se dovolj fosfata absorbira v telo iz živil, ki ga naravno vsebujejo. Fosfat uravnava celično presnovo in pomaga telesu pri vnosu različnih vitaminov. Obstajajo številni negativni učinki, ki se pojavijo, če v krvi ni dovolj fosfata. Za odpravo tega neravnovesja bolnikom lahko dajemo fosfatne soli.
Pred operacijo se pogosto dajejo fosfatne soli za čiščenje bolnikovega črevesnega trakta. To lahko pomaga preprečiti zaplete pri različnih operacijah, zlasti pri operacijah, ki vključujejo sam prebavni trakt. Fosfat vleče tekočino v črevesje in izpira vse v njih.
Natrijeve ali kalijeve fosfatne soli se lahko uporabljajo za znižanje količine kalcija v krvi. Čeprav je kalcij mineral, ki ga telo potrebuje, lahko prevelika količina povzroči nenavadno rast kosti, kot je rahitis pri otrocih. Prav tako zmanjša tveganje za ledvične kamne, tako da absorbira odvečni kalcij, ki bi sicer lahko ustvaril odlaganje kalcija v ledvicah.
Čeprav učinkovitost fosfatnih soli pri zdravljenju zgage ni bila dokazana, se te soli včasih uporabljajo za zdravljenje te motnje. V večini primerov bolnikom z blago ali občasno zgago dajemo kalcij, da pomaga absorbirati odvečno želodčno kislino. Včasih bolniki morda ne morejo zaužiti dodatnega kalcija, ker povzroča presežek tega minerala. Bolniki z že obstoječimi boleznimi, kot so ledvični kamni, ne smejo jemati dodatnega kalcija, ker bi to lahko poslabšalo stanje, zato se lahko namesto njih uporabljajo fosfatne soli.
Možno je tudi nanašanje fosfatnih soli neposredno na dlesni v obliki zobne paste. Pri uporabi v tej obliki lahko soli pomagajo zmanjšati občutljivost pacientovih zob. O tej uporabi fosfatnih soli ni bilo veliko raziskav, vendar bo treba izvesti še več, da bi ugotovili, kako učinkovita je lahko.