Povezava med omeprazolom in drisko vključuje dve komponenti. Glavna sestavina zaviralca protonske črpalke je magnezij, mineral, ki se uporablja kot odvajalo in za čiščenje črevesja pred določenimi diagnostičnimi testi in operacijo. Omeprazol in driska sta povezana tudi, ker zdravilo blokira proizvodnjo želodčne kisline in lahko zavira tudi obrambne mehanizme proti bakteriji Clostridium difficile, ki je tretji vodilni vzrok driske pri starejših osebah.
Povečano tveganje za infekcijsko drisko predstavlja stranski učinek omeprazola, ki je lahko akuten ali kroničen. Znano razmerje med omeprazolom in drisko je rezultat raziskav, ki so preučevale neželene učinke zdravila. Ena študija je pokazala, da ko se želodčna kislina zmanjša, zagotavlja bogato okolje za rast bakterij v prebavnem traktu. Nasprotna študija ni pokazala povezave med omeprazolom in drisko.
Zdravilo je predpisano za zdravljenje gastroezofagealne refluksne bolezni (GERB) in nekaterih vrst razjed. Pomaga pri celjenju peptičnih in želodčnih razjed z blokiranjem želodčne kisline, običajno olajša v 12 tednih. Nekateri bolniki uporabljajo vzdrževalne odmerke zdravila, da preprečijo ponovni pojav simptomov.
GERB se pojavi, ko želodčna kislina vstopi v požiralnik, običajno po zaužitju obroka. Običajno se poslabša, če bolnik leži nagnjeno v postelji. Nekatere snovi, kot so čokolada, kava in alkohol, lahko skupaj s kajenjem cigaret poslabšajo GERB. Nekateri bolniki lajšajo bolečino tako, da dvignejo vzglavje svoje postelje, da preprečijo regurgitacijo želodčne kisline. Omeprazol je bil odobren za uporabo pri GERB leta 1988.
Razjede na želodcu lahko povzročijo bolečino po jedi. Bolečina se lahko začne v želodcu in se razširi na hrbet ali prsni koš, kar posnema znake srčnega infarkta. Nasprotno pa se bolečina pri razjedi dvanajstnika lahko zmanjša, ko zaužijemo določeno hrano, vendar se le redko pojavi na prazen želodec. Nelagodje se običajno začne dve do tri ure po obroku, pogosto se ponoči poslabša.
Drugi neželeni učinki omeprazola vključujejo zmanjšanje sposobnosti absorpcije vitamina B12 in kalcija. To lahko poveča tveganje za zlome kosti pri ženskah po menopavzi. Med jemanjem zdravila je mogoče spremljati raven vitaminov in mineralov z dodatki za odpravo pomanjkljivosti.
Ena študija je pokazala povečano tveganje za razvoj raka želodca ali požiralnika pri bolnikih, ki trpijo za hiatalno kilo ali Barrettovim požiralnikom. Tveganje pa ni veljalo za bolnike, ki so zdravilo uporabljali za prebavne motnje, gastritis ali peptične razjede. Raziskovalci so ugotovili, da je bila sedemletna študija morda prekratka, da bi zagotovila zanesljive rezultate, ker rak pogosto traja leta, da se razvije.