Zopiklon je zdravilo, ki se pogosto predpisuje za zdravljenje nespečnosti, vendar ima tako kot večina zdravil nekaj motečih stranskih učinkov. Nekateri najpogostejši neželeni učinki zopiklona, o katerih je treba poročati zdravniku, vključujejo tesnobo, nihanje razpoloženja in zmedenost, čeprav nekateri ljudje doživljajo tudi nenadno agresivnost ali težave z dihanjem. Obstajajo tudi nekateri neželeni učinki, o katerih običajno ni treba poročati zdravniku, saj niso nevarni za zdravje in bi morali sčasoma izginiti, vključno s suhimi usti, spremembami apetita in teže ter omotico. Končno lahko nekateri neželeni učinki trajajo tudi po prekinitvi zdravljenja, kot so krči, slabost, prekomerno znojenje in povečana nespečnost.
Nekatere neželene učinke zopiklona je treba obvestiti zdravnika, ker so lahko škodljivi. Zdravniku je treba na primer omeniti zmedenost, zaspanost, okornost in zmanjšano koordinacijo, saj so ti negativni učinki lahko nevarni, zlasti pri upravljanju vozila. Pojavijo se lahko tudi nihanje razpoloženja, tesnoba, agresivnost in kožni izpuščaj, in čeprav običajno niso nevarni za zdravje bolnika, so lahko škodljivi za kakovost življenja. Simptomi, kot so piskanje, tiščanje v prsnem košu in težko dihanje, so lahko tudi strašljivi, zato naj se bolniki nemudoma obrnejo na svojega zdravnika, če opazijo te neželene učinke.
Po drugi strani pa nekateri neželeni učinki niso smrtno nevarni, kar pomeni, da običajno ne potrebujejo zdravniške pomoči, razen če so posebej moteči za bolnika. Pravzaprav se mnogi od njih umirijo, ko se telo navadi na zdravilo, zato lahko nekateri bolniki pričakujejo, da bodo opazili neželene učinke, kot so suha usta, zgaga, spremembe apetita in izguba teže. Včasih lahko postane tudi težko jasno videti ali govoriti, nekateri bolniki, ki jemljejo to zdravilo, pa lahko opazijo, da postanejo zlahka vznemirjeni. Drugi fizični simptomi, ki bi morali kmalu izginiti, lahko vključujejo mrzlico, zaprtje, omotico in bruhanje. Če se neželeni učinki nadaljujejo po redni uporabi zdravila ali jih je težko prezreti, morajo bolniki običajno obvestiti svojega zdravnika.
Medtem ko nekateri neželeni učinki zopiklona niso posebej nevarni ali dolgotrajni, drugi trajajo tudi po prenehanju uporabe zdravila. Na primer, želodčni krči, bruhanje in slabost se lahko nadaljujejo tudi po prenehanju uporabe zdravila. Pojavi se lahko tudi nespečnost, ki je hujša kot prej, morda delno zaradi tesnobe, prekomernega potenja in splošnega nemira, ki se lahko začne po prenehanju jemanja zdravila. Običajno svetujemo, da bolniki obvestijo svojega zdravnika, ko opazijo te negativne učinke.